Prof. Dr. ÖZGÜL PERSİL ÇETİNKOL

Metrikler

Yayın

Yayın (WoS)

Yayın (Scopus)

Atıf (WoS)

788

H-İndeks (WoS)

Atıf (Scopus)

788

H-İndeks (Scopus)

Atıf (Scholar)

854

H-İndeks (Scholar)

Atıf (TrDizin)

H-İndeks (TrDizin)

Atıf (Diğer Toplam)

Proje

Tez Danışmanlığı

Açık Erişim

BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Eğitim Bilgileri

2002 - 2008

Doktora

Georgia Institute of Technology, College of Sciences, School Of Chemistry and Biochemistry, Amerika Birleşik Devletleri

1997 - 2002

Lisans

Koç Üniversitesi, Fen Fakültesi, Kimya Bölümü, Türkiye

Yaptığı Tezler

2008

Doktora

SMALL MOLECULE RECOGNITION OF HOMOPURINE NUCLEIC ACID STRUCTURES

Georgia Institute Of Technology, School Of Chemıstry And Bıochemıstry

Yabancı Diller

C1 İleri

İngilizce

Araştırma Alanları

Kimya

Biyokimya

Temel Bilimler

Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları

Avesis Araştırma Alanları

WoS Araştırma Alanları

Scopus Araştırma Alanları

Akademik Ünvanlar / Görevler

2025 - Devam Ediyor

Prof. Dr.

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü

2018 - 2025

Doç. Dr.

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü

2015 - 2018

Yrd. Doç. Dr.

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü

2010 - 2012

Yrd. Doç. Dr.

Doğuş Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü

2008 - 2010

Araştırma Görevlisi

Lawrence Berkeley National Laboratory, Physical Biosciences Division, Joint Bioenergy Institute

2002 - 2008

Araştırma Görevlisi

Georgia Institute of Technology, College Of Sciences, School Of Chemistry And Biochemistry

Yönetimsel Görevler

2024 - 2025

Bölüm Başkan Danışmanı

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü

2021 - 2024

Anabilim/Bilim Dalı Başkanı

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyokimya Anabilim Dalı

2018 - 2021

Bölüm Başkan Yardımcısı

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü

Akademi Dışı Deneyim

2013 - 2015

Ar-Ge Proje Uzmanı

Zentiva Sağlık Ürünleri Sanayi ve Ticaret Anonim Şirketi, Ar-Ge Proje Uzmanı

2010 - 2011

Misafir Araştırmacı

Lawrence Berkeley National Laboratory - Joint BioEnergy Institute, Misafir Araştırmacı

2008 - 2010

Postdoc

Lawrence Berkeley National Laboratory - Joint BioEnergy Institute, Postdoc

2002 - 2010

Araştırma Görevlisi

Georgia Institute of Technology, Araştırma Görevlisi

1998 - 2002

Araştırma Asistanı

Koç Üniversitesi, Araştırma Asistanı

2001 - 2001

Stajer

Max Planck Institute-Solid State Chemistry Division, Stajer

2000 - 2000

Stajer

Evonik Industries AG (Formerly- Degussa AG), Stajer

Verdiği Dersler

Yüksek Lisans

ADVANCED CHEMICAL PERSECTIVES IN BIOCHEMISTRY

Lisans

Genel Kimya II

BIOCHEMISTRY

GENERAL CHEMISTRY I

CHEMISTRY OF METABOLIC PATHWAYS

General Chemistry

Yönetilen Tezler

2022

Yüksek Lisans

Investigating the interactions of poly(A)-coralyne in crowded environments and the effect of DNA methylation on DDD-lysine and DDD-arginine interactions

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Danışman)

Z.SUVACI(Öğrenci)

2022

Yüksek Lisans

Affinity and selectivity of azacyanines to G-quadruplex forming promoter regions

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Danışman)

F.NUR(Öğrenci)

2022

Yüksek Lisans

Electrochemical detection of oxaliplatin induced DNA damage in G-quadruplex structures

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Danışman)

S.CAN(Öğrenci)

2022

Yüksek Lisans

Synthesis of highly fluorescent N, S co-doped carbon quantum dots and their application in fluorometric detection of G-quadruplex forming HER2 promoter region

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Danışman)

Z.İREM(Öğrenci)

2022

Yüksek Lisans

G-quadruplexes: Targeting with azacyanines and application to hydroxychloroquine detection

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Danışman)

K.DOĞAN(Öğrenci)

2022

Yüksek Lisans

A new method for hydroxychloroquine detection

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Danışman)

D.ÜNAL(Öğrenci)

2020

Yüksek Lisans

Üçlü nükleik asit yapılarının azasiyaninlerle etkileşimlerinin incelenmesi

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Danışman)

S.Tütüncü(Öğrenci)

2019

Yüksek Lisans

Targeting human telomeric DNA with azacyanines

Persil Çetinkol Ö. (Danışman)

A.DOĞU(Öğrenci)

2018

Yüksek Lisans

INSIGHTS INTO THE ACTION MECHANISM OF AZACYANINES: THEIR TOPOISOMERASE II? INHIBITION POTENTIAL AND NUCLEIC ACID SELECTIVITY

PERSİL ÇETİNKOL Ö.

S.Güloğlu(Öğrenci)

2018

Yüksek Lisans

Insights into the action mechanism of azacyanines: Their topoisomerase iiα inhibition potential and nucleic acid selectivity

Persil Çetinkol Ö. (Danışman)

S.GÜLOĞLU(Öğrenci)

Makaleler

2024

1. Fluorometric and colorimetric platforms for rapid and sensitive hydroxychloroquine detection in aqueous samples

Doğan K., Ünal Taş D., Persil Çetinkol Ö., Forough M.

TALANTA , cilt.270, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)

2023

2. Electrochemical detection of Oxaliplatin induced DNA damage in G-quadruplex structures

Osmanoğulları S. C., FOROUGH M., PERSİL ÇETİNKOL Ö., UDUM Y., Toppare L.

ANALYTICAL BIOCHEMISTRY , cilt.671, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)

2022

3. Coumarin 6H-fused fluorescent probe for highly sensitive detection of coralyne using oligonucleotide-modified silver nanoparticles.

Usta H. M., Forough M., Persil Çetinkol Ö.

Analytical and bioanalytical chemistry , cilt.414, sa.24, ss.7299-7313, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

4. A CpG island promoter drives the CXXC5 gene expression

Yasar P., Kars G., Yavuz K., Ayaz G., Oguztuzun C., Bilgen E., et al.

SCIENTIFIC REPORTS , cilt.11, sa.1, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2021

5. Highly-sensitive and fast detection of human telomeric G-Quadruplex DNA based on a hemin-conjugated fluorescent metal-organic framework platform

Javan Kouzegaran V., Farhadi K., Forough M., Bahram M., Persil Çetinkol Ö.

Biosensors and Bioelectronics , cilt.178, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)

2020

6. Doxorubicin exhibits strong and selective association with VEGF Pu22 G-quadruplex

Bilgen E., Persil Çetinkol Ö.

Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects , cilt.1864, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)

2020

7. Construction of amperometric biosensor modified with conducting polymer/carbon dots for the analysis of catechol

Yasa M., Deniz A., Forough M., YILDIRIM E., PERSİL ÇETİNKOL Ö., Udum Y. A., et al.

Journal of Polymer Science , cilt.58, sa.23, ss.3336-3348, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)

2020

8. Novel fluorescent azacyanine compounds: Improved synthesis and optical properties

Doğan K., Gülkaya A., Forough M., Persil Ç.

ACS Omega , cilt.5, sa.36, ss.22874-22882, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)

2020

9. A conjugated gold nanoparticle-azacyanine off-on-off fluorescence probe for sensitive and selective detection of G-quadruplexes

Bilgen E., Forough M., PERSİL ÇETİNKOL Ö.

Talanta , cilt.217, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)

2020

10. Azacyanines as novel topoisomerase II alpha inhibitors

Guloglu S., Kirmaci F. N., PERSİL ÇETİNKOL Ö., Forough M., Gulkaya A.

Letters in Drug Design and Discovery , cilt.17, sa.5, ss.664-669, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)

2019

11. A DNA-free colorimetric probe based on citrate-capped silver nanoparticles for sensitive and rapid detection of coralyne

Usta H. M., Forough M., Cetinkol Ö.

Sensors and Actuators, B: Chemical , cilt.298, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)

2019

12. Targeting human telomeric DNA with azacyanines

Kucukakdag Dogu A., Persil Çetinkol Ö.

TURKISH JOURNAL OF CHEMISTRY , cilt.43, ss.1040-1051, 2019 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)

2018

13. Selective High Binding Affinity of Azacyanines to polyd(A) center dot polyd(T) center dot polyd(T) Triplex: The Effect of Chain Length and Branching on Stabilization, Selectivity and Affinity

Tutuncu S., Guloglu S., Kucukakdag A., Persil Çetinkol Ö.

CHEMISTRYSELECT , cilt.3, sa.45, ss.12878-12887, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)

2015

14. How Alkyl Chain Length of Alcohols Affects Lignin Fractionation and Ionic Liquid Recycle During Lignocellulose Pretreatment

SATHITSUKSANOH N., Sawant M., TRUONG Q., Tan J., Canlas C. G., Sun N., et al.

BIOENERGY RESEARCH , cilt.8, sa.3, ss.973-981, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)

2012

15. Structural and Chemical Characterization of Hardwood from Tree Species with Applications as Bioenergy Feedstocks

PERSİL ÇETİNKOL Ö., SMITHMORITZ A., CHENG G., LAO J., GEORGE A., HONG K., et al.

PLOS ONE , cilt.7, sa.12, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

2012

16. Biosynthesis and incorporation of side-chain-truncated lignin monomers to reduce lignin polymerization and enhance saccharification

EUDES A., GEORGE A., MUKERJEE P., KIM J., POLLET B., BENKE P., et al.

PLANT BIOTECHNOLOGY JOURNAL , cilt.10, sa.5, ss.609-620, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

2012

17. The impact of ionic liquid pretreatment on the chemistry and enzymatic digestibility of Pinus radiata compression wood

TORR K., LOVE K., PERSİL ÇETİNKOL Ö., DONALDSON L., GEORGE A., HOLMES B., et al.

GREEN CHEMISTRY , cilt.14, sa.3, ss.778-787, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)

2011

18. A facile method for the recovery of ionic liquid and lignin from biomass pretreatment

DIBBLE D., LI C., LAN S., GEORGE A., CHENG A., PERSİL ÇETİNKOL Ö., et al.

GREEN CHEMISTRY , cilt.13, sa.11, ss.3255-3264, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)

2010

19. Understanding the impact of ionic liquid pretreatment on eucalyptus

PERSİL ÇETİNKOL Ö., DIBBLE D., CHENG G., KENT M., KNIERIM B., AUER M., et al.

Biofuels , cilt.1, ss.33-46, 2010 (Scopus)

2009

20. Molecular dynamics simulations and coupled nucleotide substitution experiments indicate the nature of A center dot A base pairing and a putative structure of the coralyne-induced homo-adenine duplex

Joung I. S., Cetinkol O. P., HUD N. V., Cheatham T. E.

NUCLEIC ACIDS RESEARCH , cilt.37, sa.22, ss.7715-7727, 2009 (SCI-Expanded, Scopus)

2009

21. Molecular recognition of poly(A) by small ligands: an alternative method of analysis reveals nanomolar, cooperative and shape-selective binding

Cetinkol O. P., Hud N. V.

NUCLEIC ACIDS RESEARCH , cilt.37, sa.2, ss.611-621, 2009 (SCI-Expanded, Scopus)

2008

22. Submicromolar, selective G-quadruplex ligands from one pot: Thermodynamic and structural studies of human telomeric DNA binding by azacyanines

Cetinkol O. P., ENGELHART A. E., Nanjunda R. K., Wilson W. D., HUD N. V.

CHEMBIOCHEM , cilt.9, sa.12, ss.1889-1892, 2008 (SCI-Expanded, Scopus)

2007

23. Harnessing DNA intercalation

Persil O., HUD N. V.

TRENDS IN BIOTECHNOLOGY , cilt.25, sa.10, ss.433-436, 2007 (SCI-Expanded, Scopus)

2004

24. Assembly of an antiparallel homo-adenine DNA duplex by small-molecule binding

Persil O., SANTAI C., JAIN S., HUD N.

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY , cilt.126, sa.28, ss.8644-8645, 2004 (SCI-Expanded, Scopus)

2003

25. Na12Ge17: A compound with the zintl anions [Ge-4](4-) and [Ge-9](4-) - Synthesis, crystal structure, and Raman spectrum

CARRILLO-CABRERA W., GIL R., SOMER M., Persil O., VON SCHNERING H.

ZEITSCHRIFT FUR ANORGANISCHE UND ALLGEMEINE CHEMIE , cilt.629, sa.4, ss.601-608, 2003 (SCI-Expanded, Scopus)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

2019

1. DNA Metilasyonunun DNA Yapısı ve DNA-Doksorubisin Etkileşimleri Üzerindeki Etkileri

ÇAVDAR G., PERSİL ÇETİNKOL Ö.

Uluslararası Katılımlı 20. Biyoteknoloji Kongresi, Türkiye, 10 - 12 Ekim 2019, (Özet Bildiri)

2018

2. Benzimidazol Türevi Azasiyaninlerin Seçiciliği

TUTUNCU S., KUCUKAKDAG A., GULOGLU S., PERSİL ÇETİNKOL Ö.

Uluslararası Katılımlı 6. İlaç Kimyası: İlaç Etkin MaddesiTasarımı, Sentezi, Üretimi ve StandardizasyonuKongresi, 22 - 25 Mart 2018, (Özet Bildiri)

2016

3. G Dörtlü Sarmal Yapısına Sahip Telomerik Dna Dizinleri ile Azasiyaninlerin Etkileşimleri

PERSİL ÇETİNKOL Ö.

4. İlaç Kimyası Kongresi: İlaç Etkin Maddesi Tasarımı, Sentezi, Üretimi ve Standardizasyonu KOngresi, Türkiye, 17 - 20 Mart 2016

2010

4. Structural characterization of Eucalyptus species

PERSİL ÇETİNKOL Ö., SMITH M., GEORGE A., CHENG G., BRENNAN T., HENRY R., et al.

ACS Spring 2010 National Meeting & Exposition, 21 - 25 Mart 2010

2010

5. Harnessing the effect of ionic liquid pretreatment on Eucalyptus

PERSİL ÇETİNKOL Ö.

ACS Spring 2010 National Meeting & Exposition, 21 - 25 Mart 2010

2009

6. Selective High Affinity Synthetically Accessible Ligands for G Quadruplex DNA Thermodynamic and Structural Studies of Azacyanines

ENGELHART A., PERSİL ÇETİNKOL Ö., NANJUNDA R., WILSON D., HUD N.

Albany 2009: The 16th Conversation, 16 - 20 Haziran 2009

2009

7. Small molecules that enhance GAA TTC fragility

LOBACHEV K., KIM H., NARAYANAN V., PERSİL ÇETİNKOL Ö., HUD N.

Albany 2009: The 16th Conversation, 16 - 20 Haziran 2009

2009

8. 2 D NMR Investigation of Ionic Liquid Pretreatment on Eucalyptus

PERSİL ÇETİNKOL Ö., DIBBLE D., PELTON J., WEMMER D., SIMMONS B., HOLMES B., et al.

31st Syposium on Biotechnology for Fuels&Chemicals, 3 - 06 Mayıs 2009

2009

9. Identification of Genes Involved in Acetylation of Cell Wall Polysaccharides in Arabidopsis thaliana

MANABE Y., SMITH M., ORFILA C., MANISSERI C., PERSİL ÇETİNKOL Ö., HOLMES B., et al.

Genomics of Energy and Environment; Fourth Annual DOE Joint Genome Institute User Meeting, 25 - 27 Mart 2009

2008

10. Nanomolar Selective G Quadruplex Ligands from One Pot Thermodynamic and Structural Studies of Azacyanines

ENGELHART A., PERSİL ÇETİNKOL Ö., NANJUNDA R., WILSON D., HUD N.

Southeast Regional Meeting of the ACS, 12 - 15 Kasım 2008

2006

11. Exploring small molecules that promote the poly rA self structure

PERSİL ÇETİNKOL Ö., HUD N.

Southeast Regional Meeting of the ACS, 1 - 04 Kasım 2006

2005

12. Controlling nucleic acid assembly by small molecule binding Formation of antiparallel dA n dA n duplexes in the presence of coralyne

PERSİL ÇETİNKOL Ö., SANTAI C., JAIN S., HUD N.

Albany 2005: The 14th Conversation, 14 - 18 Haziran 2005

Kitaplar

2022

1. Biosensors for Nucleic Acid Detection

Persil Çetinkol Ö.

Advanced Sensor Technology Biomedical, Environmental, and Construction Applications, Ahmed Barhoum,Zeynep Altintas, Editör, Elsevier Science, Oxford/Amsterdam , New York, ss.173-233, 2022

2014

2. Small molecule recognition of poly(A)

PERSİL ÇETİNKOL Ö.

Polyadenylation Methods and Protocols, Rorbach Joanna, Bobrowicz Agnieszka J., Editör, Springer, New-York, ss.81-108, 2014

2009

3. Metal Ion Interactions with G-Quadruplex Structures

AARON E., PLAVEC J., PERSİL ÇETİNKOL Ö., HUD N.

Nucleic Acid Metal Ion Interactions, Hud, Nicholas, Editör, RSC Publishing, Cambridge, ss.118-153, 2009

Desteklenen Projeler

2023 - 2024

Altın Nanoçubukları Kullanarak İnsan Telomerik DNAsı Tespiti İçin Yeni Bir Kolorimetrik Platform Geliştirilmesi Gold Nanorods As A New Colorimetric Platform For The Detection Of Human Telomeric DNA

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü), KÜÇÜKERENKÖY S.

2021 - 2022

Oksaliplatinin yarattığı DNA hasarının diferansiyal puls voltametri yöntemi ile tespiti

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü), BULUT Z. İ., OSMANOĞULLARI S. C.

2021 - 2022

Benzotiyazol Türevlerinin Farklı Nükleik Asit Yapılarına Karşı Seçiciliklerinin Belirlenmesi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü), DOĞAN K.

2018 - 2019

BENZİMİDAZOL TÜREVİ İLAÇ ADAYI BİLEŞİĞİNİN İNSAN TELEMORİK DNA'SI İLE ETKİLEŞİMLERİNİN İNCELENMESİ

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü), KÜÇÜKAKDAĞ A.

2018 - 2019

Lüminesan MCM-41 Mezogözenekli Silika Nanoparçacıklarına Selekoksib Yükleme Çalışmaları: İlaç Yükleme ve Bırakma Özellikleri

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

YILMAZ A. (Yürütücü), AKMAN P., GÖKAĞAÇ ARSLAN G., ÇORUH N., NALBANT ESENTÜRK E., KAYRAN İŞÇİ C., et al.

2017 - 2017

AZA3 MOLEKÜLÜNÜN TOPOİZOMERAZ I ENZİMİ İLE OLAN ETKİLEŞİMLERİNİN İNCELENMESİ

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü)

2017 - 2017

Değişik destek maddeleri kullanılarak yeni katalizörlerin hazırlanması

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

GÖKAĞAÇ ARSLAN G. (Yürütücü), YILMAZ A., ÇORUH N., NALBANT ESENTÜRK E., KAYRAN İŞÇİ C., PERSİL ÇETİNKOL Ö.

2017 - 2017

AZASİYANIN 3 BİLEŞİĞİNİN NÜKLEİK ASİTLER İLE ETKİLEŞMLERİNİN İNCELENMESİ

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü)

2017 - 2017

AZA3 TÜREVİ İLAÇ ADAYI BİLEŞİĞİNİN İNSAN TELEMORİK DNA'SI İLE ETKİLEŞİMLERİNİN İNCELENMESİ

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü)

2016 - 2017

Üç Yeni İlaç Adayı Bileşiğin Sentezi, Karakterizasyonu ve İnsan Telemorik DNA’sı İle Etkileşimlerinin İncelenmesi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

PERSİL ÇETİNKOL Ö. (Yürütücü)

2016 - 2016