Metrikler
Yayın
29
Açık Erişim
3
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Eğitim Bilgileri
2005 - 2011
2005 - 2011Bütünleşik Doktora
Harvard University, Amerika Birleşik Devletleri
2001 - 2005
2001 - 2005Lisans
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü, Türkiye
Araştırma Alanları
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Akademik Ünvanlar / Görevler
2018 - Devam Ediyor
2018 - Devam EdiyorDr. Öğr. Üyesi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü
2016 - 2018
2016 - 2018Yrd. Doç. Dr.
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü
Yönetilen Tezler
2023
2023Yüksek Lisans
Investigating the role and regulation of H3K36 methylation in neuroectodermal lineage commitment of mouse embryonic stem cells
Terzi Çizmecioğlu N. (Danışman)
D.SEZGİNMERT(Öğrenci)
2023
2023Yüksek Lisans
The effect of SETD3 on beta-catenin and canonical WNT signaling pathway activity in mouse embryonic stem cells
Terzi Çizmecioğlu N. (Danışman)
C.ALGANATAY(Öğrenci)
2022
2022Yüksek Lisans
Setd3-dependent gene expression changes during endoderm differentiation of mouse embryonic stem cells
Terzi Çizmecioğlu N. (Danışman)
E.BALBAŞI(Öğrenci)
2021
2021Yüksek Lisans
Identification of protein partners of SETD3 in mouse embryonic stem cells
Terzi Çizmecioğlu N. (Danışman)
G.GÜVEN(Öğrenci)
2019
2019Yüksek Lisans
Fare embriyonik kök hücrelerde Arid4b proteiniyle etkileşen transkripsiyon faktörlerinin bulunması
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N. (Danışman)
E.Gül(Öğrenci)
Makaleler
Tümü (14)
SCI-E, SSCI, AHCI (12)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (13)
ESCI (1)
Scopus (14)
TRDizin (3)
2025
20251. SET domain containing 3 (SETD3) interacts with bromodomain-containing protein 2 (BRD2) and coordinates its chromatin association in mouse embryonic stem cells.
Sezginmert D., Guven G., Alganatay C., Ak D., Terzi Cizmecioglu N.
The FEBS journal
, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20242. SETD3 regulates endoderm differentiation of mouse embryonic stem cells through canonical Wnt signaling pathway
Alganatay C., Balbasi E., Tuncbag N., Sezginmert D., Terzi Çizmecioğlu N.
FASEB JOURNAL
, cilt.38, sa.4, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20243. Roles and Regulation of H3K4 Methylation During Mammalian Early Embryogenesis and Embryonic Stem Cell Differentiation.
Terzi Cizmecioglu N.
Advances in experimental medicine and biology
, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20244. Application of CRISPR/Cas9 Pooled Screening for a Non-immediate Readout Model
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
, cilt.2849, ss.87-116, 2024 (Scopus)
2023
20235. Cholesterol biogenesis is a PTEN-dependent actionable node for the treatment of endocrine therapy-refractory cancers
Kaysudu I., Gungul T. B., Atici S., Yilmaz S., Bayram E., GÜVEN G., et al.
CANCER SCIENCE
, cilt.114, sa.11, ss.4365-4375, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
20236. ARID4B loss leads to activated STAT1-dependent interferon pathway in mouse embryonic stem cells and during meso/endodermal differentiation.
Terzi Çizmecioğlu N.
Journal of the Turkish German Gynecological Association
, cilt.24, sa.3, ss.187-196, 2023 (ESCI, Scopus, TRDizin)
2023
20237. Histone proteomics implicates H3K36me2 and its regulators in mouse embryonic stem cell pluripotency exit and lineage choice
Terzi Çizmecioğlu N., Sezginmert D.
TURKISH JOURNAL OF BIOCHEMISTRY , cilt.48, sa.4, ss.351-361, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
20218. Arid4b alters cell cycle and cell death dynamics during mouse embryonic stem cell differentiation.
GÜven G., Terzİ ÇİzmecİoĞlu N.
Turkish journal of biology = Turk biyoloji dergisi
, cilt.45, sa.1, ss.56-64, 2021 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2021
20219. Arid4b physically interacts with Tfap2c in mouse embryonic stem cells
Keskin E. G., Huang J., TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
, cilt.45, sa.2, ss.162-170, 2021 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2020
202010. ARID4B is critical for mouse embryonic stem cell differentiation towards mesoderm and endoderm, linking epigenetics to pluripotency exit
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N., Huang J., Keskin E. G., Wang X., Esen I., Chen F., et al.
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
, cilt.295, sa.51, ss.17738-17751, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2017
201711. Microprocessor Recruitment to Elongating RNA Polymerase II Is Required for Differential Expression of MicroRNAs
Church V. A., Pressman S., Isaji M., Truscott M., Cizmecioglu N., Buratowski S., et al.
CELL REPORTS
, cilt.20, sa.13, ss.3123-3134, 2017 (SCI-Expanded, Scopus)
2011
201112. H3K4 trimethylation by Set1 promotes efficient termination by the Nrd1-Nab3-Sen1 pathway.
Terzi N., Churchman L., Vasiljeva L., Weissman J., Buratowski S.
Molecular and cellular biology
, cilt.31, ss.3569-83, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)
2008
200813. Transcription termination and RNA degradation contribute to silencing of RNA polymerase II transcription within heterochromatin.
Vasiljeva L., Kim M., Terzi N., Soares L., Buratowski S.
Molecular cell
, cilt.29, ss.313-23, 2008 (SCI-Expanded, Scopus)
2005
200514. An embryonic poly(A)-binding protein (ePAB) is expressed in mouse oocytes and early preimplantation embryos.
Seli E., Lalioti M., Flaherty S., Sakkas D., Terzi N., Steitz J.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
, cilt.102, ss.367-72, 2005 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2023
20231. BRD2 Interacts with SETD3 in Mouse Embryonic Stem Cells
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
Turkish Proteomics Association TuPA2023 International Congress, Ankara, Türkiye, 13 - 14 Ekim 2023, (Özet Bildiri)
2022
20222. Setd3-dependent gene expression changes during endoderm differentiation of mouse embryonic stem cells
Balbaşı E., TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
1st International Congress of Histology and Embryology, Türkiye, 26 - 28 Mayıs 2022, (Özet Bildiri)
2020
20203. Embriyonik Kök Hücrelerde Setd3 Proteiniyle İlişkili Proteinlerin Proteomik Açıdan Belirlenmesi
GÜVEN G., Keskin E. G., Balbaşı E., TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
3. Ulusal Proteomik Kongresi, İstanbul, Türkiye, 27 - 29 Şubat 2020, (Özet Bildiri)
2019
20194. The Effect of Sin3a Complex on Cell Cycle and Cell Death in Mouse Embryonic Stem Cells
GÜVEN G., TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
7th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 27 - 29 Eylül 2019
2019
20195. Identification of Transcription Factors that Interact with Arid4b in Mouse Embryonic Stem Cells
Keskin E. G., TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
7th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, İstanbul, Türkiye, 27 - 29 Eylül 2019
2019
20196. Chromatin Dynamics in Lineage Decisions
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
7th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey, 27 - 29 Eylül 2019, (Özet Bildiri)
2017
20177. Chromatin alters the lineage potential of mouse embryonic stem cells.
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N., Huang J., Keskin E. G., Wang X., Esen İ., Orkin S. H.
International Society for Stem Cell Research (ISSCR) 2017 Annual Meeting, Boston, Amerika Birleşik Devletleri, 14 - 17 Haziran 2017, (Özet Bildiri)
2017
20178. Chromatin alters the lineage potential of mouse embryonic stem cells
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N., Huang J., Keskin E. G., Wang X., Esen İ., Orkin S. H.
BIOMED2017, Ankara, Türkiye, 12 Mayıs 2017 - 14 Ocak 2018, (Özet Bildiri)
2015
20159. Epigenetic Control of Lineage Commitment of Mouse Embryonic Stem Cells
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
4th International Congress of Molecular Biology Association of Turkey (MolBiyoKon 2015), Ankara, Türkiye, 27 - 29 Kasım 2015, (Özet Bildiri)
Kitaplar
2024
20241. Roles and Regulation of H3K4 Methylation During Mammalian Early Embryogenesis and Embryonic Stem Cell Differentiation
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N.
Advances in Experimental Medicine and Biology: Cell Biology and Translational Medicine, , Editör, Springer Nature, ss.73-96, 2024
Desteklenen Projeler
2023 - 2024
2023 - 2024Kalıcı Olarak Cas9 İfade Eden Fare Embriyonik Kök Hücre Hattı Oluşturulması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N. (Yürütücü), BALBAŞI E.
2023 - 2024
2023 - 2024Fare embriyonik kök hücrelerinin farklılaşmasında ING12 ifade seviyeleri belirlenmesi ve CRISPRCas9 bazlı nakavt hat eldesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N. (Yürütücü)
2022 - 2024
2022 - 2024SETD3 proteininin çekirdek lokalizasyonunun fare embriyonik kök hücre farklılaşması üzerindeki etkisinin belirlenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N. (Yürütücü)
2022 - 2023
2022 - 2023Fare Embriyonik Kök Hücrelerinin Nöroektoderm Tabakasına Farklılaşma Sürecinde H3K36me2 Demetilazlar ve Okuyucu Proteinlerinin İfade Değişimi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Y.Lisans
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N. (Yürütücü), SEZGİNMERT D.
2022 - 2022
2022 - 2022FARE EMBRİYONİK KÖK HÜCRELERİNDE ÇEKİRDEK İZOLE EDİLEREK YAPILAN KROMATİN İMMÜNOPRESİPİTASYON OPTİMİZASYONU
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N. (Yürütücü), GÜVEN G.
2021 - 2022
2021 - 2022Nöroektoderm farklılaşmasında H3K36 metilasyonundaki değişiminin incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
TERZİ ÇİZMECİOĞLU N. (Yürütücü)
Bilimsel Yayınlarda Hakemlikler
Ağustos 2021
Ağustos 2021TURKISH JOURNAL OF BIOLOGY
SCI-E Kapsamındaki Dergi
Bilimsel Projelerde Hakemlikler
Kasım 2023
Kasım 2023TÜBİTAK Projesi
1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Türkiye
Haziran 2023
Haziran 2023TÜBİTAK Projesi
1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Türkiye
Mayıs 2022
Mayıs 2022TÜBİTAK Projesi
1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Türkiye
Ödüller
Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri
27 Eylül 2019 - 29 Eylül 2019
27 Eylül 2019 - 29 Eylül 2019