Identification of protein partners of SETD3 in mouse embryonic stem cells

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2021

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: GÖZDE GÜVEN

Danışman: Nihal Terzi Çizmecioğlu

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Embriyonik gelişim hızlı hücre bölünmelerinin bulunduğu, son derece planlı ve düzenli bir süreçtir. Bu süreçte embriyo farklılaşmaya başlar ve gelişimin sonunda hücreler tamamen farklılaşmıştır. Farklılaşmaya karar aşaması çeşitli histon ve kromatin düzenleyici kompleksler gibi birçok epigenetik faktör tarafından düzenlenir. SETD3, bu pluripotent-farklılaşma dengesinin yönetilmesinde görevli histon metiltransferazlardan biridir. Daha önceki çalışmalarımızda, SETD3'ün fare EKH'lerinin mezendoderm tabakasına farklılaşmasında gerekli bir protein olduğunu belirledik. Buna rağmen, SETD3'ün hücre çekirdeğindeki diğer protein partnerleri tam olarak bilinmemektedir. IP-MS deneyimizle belirlediğimiz aday proteinler için derinlemesine bir analiz yaptık. Ardından, biyokimyasal deneyler ile BRD2 ve TFCP2L1 proteinlerinin SETD3 metil transferazının protein partnerleri olduğunu gösterdik.