Prof. Dr. TOLGA CAN


Enformatik Enstitüsü, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü


WoS Araştırma Alanları: Bilgisayar Bilimi Bilgi Sistemleri, Yaşam Bilimleri (Life), Bilgisayar Bilimi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Bilgisayar Bilimi İnterdisipliner Uygulamalar, Mühendislik Bilişim Ve Teknoloji (Eng)


Avesis Araştırma Alanları: Bilgisayar Bilimleri, Biyoenformatik, Mühendislik ve Teknoloji

Araştırmacı kurumdan ayrılmıştır

E-posta: tcan@metu.edu.tr
İş Telefonu: +90 312 210 2080 Dahili: 2080
Fax Telefonu: +90 312 210 5544
Web: http://user.ceng.metu.edu.tr/~tcan/
Ofis: Bilgisayar Muhendisligi B-109

Metrikler

Yayın

57

Yayın (WoS)

42

Yayın (Scopus)

40

Atıf (WoS)

666

H-İndeks (WoS)

13

Atıf (Scopus)

728

H-İndeks (Scopus)

14

Atıf (Scholar)

146

H-İndeks (Scholar)

6

Proje

14

Fikri Mülkiyet

1

Tez Danışmanlığı

36

Açık Erişim

48
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Biyografi

Tolga Can, 1998 yılında Orta Doğu Teknik Üniversitesi'nden Bilgisayar Mühendisliği lisans derecesini, 1998 yılında University of California, Santa Barbara'dan Bilgisayar Bilimi alanında doktora derecesini aldı. Halen Orta Doğu Teknik Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği bölümünde profesördür. Başlıca araştırma alanları arasında biyoenformatik ve algoritmalar yer almaktadır. Protein yapısı görselleştirme ve hizalaması ve büyük ölçekli protein-protein etkileşim ağlarının oluşturulması ve analizi üzerinde çalışmaları vardır.

Eğitim Bilgileri

2000 - 2004

2000 - 2004

Doktora

University of California, Santa Barbara, Bilgisayar Bilimleri, Amerika Birleşik Devletleri

1994 - 1998

1994 - 1998

Lisans

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü, Türkiye

Araştırma Alanları

Bilgisayar Bilimleri

Biyoenformatik

Mühendislik ve Teknoloji

Akademik Ünvanlar / Görevler

2017 - Devam Ediyor

2017 - Devam Ediyor

Prof. Dr.

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

2011 - 2017

2011 - 2017

Doç. Dr.

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

2007 - 2011

2007 - 2011

Yrd. Doç. Dr.

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

2006 - 2007

2006 - 2007

Öğretim Görevlisi

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

2000 - 2005

2000 - 2005

Araştırma Görevlisi

University of California, Santa Barbara, College Of Engineering, Computer Science

Yönetimsel Görevler

2007 - 2010

2007 - 2010

Bölüm Başkan Yardımcısı

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

Akademi Dışı Deneyim

2007 - Devam Ediyor

2007 - Devam Ediyor

Assistant Professor

METU, Assistant Professor

2006 - 2007

2006 - 2007

Instructor/Reader

METU, Instructor/Reader

2004 - 2005

2004 - 2005

Postdoctoral Researcher

University of California, Santa Barbara, Postdoctoral Researcher

2001 - 2004

2001 - 2004

Assistant

University of California, Santa Barbara, Assistant

1998 - 2000

1998 - 2000

Assistant

METU, Assistant

Yönetilen Tezler

2019

2019

Yüksek Lisans

Şehiriçi sürüş senaryoları için mini otonom araç mimarisi.

CAN T. (Danışman)

G.Karabulut(Öğrenci) Creative Commons License

2017

2017

Yüksek Lisans

A layout algorithm for visualization of graph alignments

CAN T. (Danışman)

A.AKARSU(Öğrenci) Creative Commons License

2014

2014

Yüksek Lisans

Modeling of split step parabolic wave equation using the graphics processing unit

CAN T. (Eş Danışman), ŞENER C. (Eş Danışman)

S.SEKMEN(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

2014

2014

Yüksek Lisans

GPU accelerated radio wave propagation modeling using ray tracing

CAN T. (Eş Danışman), ŞENER C. (Eş Danışman)

A.ZUBAROĞLU(Öğrenci) Creative Commons License

2013

2013

Yüksek Lisans

Analysis of 3'UTR shortening events in breast cancer

CAN T. (Danışman)

O.BALOĞLU(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

2013

2013

Yüksek Lisans

A framework for gene co-expression network analysis of lung cancer

CAN T. (Eş Danışman), AYDIN SON Y. (Eş Danışman)

E.AKDEMİR(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

2011

2011

Yüksek Lisans

Parallelization of functional flow to predict protein functions

CAN T. (Danışman)

E.AKKOYUN(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

2011

2011

Yüksek Lisans

Machine learning methods for promoter region prediction

CAN T. (Danışman)

H.ARSLAN(Öğrenci) Creative Commons License

2010

2010

Yüksek Lisans

A distributed graph mining framework based on mapreduce

CAN T. (Danışman)

S.ALKAN(Öğrenci) Creative Commons License

2010

2010

Yüksek Lisans

A 3D topological tracking system for augmented reality

CAN T. (Danışman)

M.ERCAN(Öğrenci) Creative Commons License

2007

2007

Yüksek Lisans

A classification system for the problem of protein subcellular localization

CAN T. (Eş Danışman), ATALAY M. V. (Eş Danışman)

G.ALAY(Öğrenci) Creative Commons License

Makaleler

Tümü (33)
SCI-E, SSCI, AHCI (32)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (32)
Scopus (32)
Diğer Yayınlar (1)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

2021

2021

1. HNRNPA1 Isoform Switch in Breast Cancer

ÖZGÜL İ., Erdem M., Döken D. N., GÜRCÜOĞLU I., GÜNTEKİN ERGÜN S., Cetin Atalay R., et al.

Frontiers in Cancer Science 2021, Singapur, 1 - 03 Kasım 2021, cilt.1, ss.28, (Özet Bildiri)

2018

2018

2. Transcription Elongation in Connection to 3’UTR Ends

ÖZGÜL İ., CAN T., ERSON BENSAN A. E.

Moleküler Biyoloji Kongresi MolBiyoKON18, İzmir, Türkiye, 5 - 08 Eylül 2018, ss.20, (Özet Bildiri)

2018

2018

3. Deregulated APA and cancer specific APA isoforms

Begik O., Ercan M., Cingoz H., CAN T., ÖYKEN M., Erson-Bensan A. E.

Annual Meeting of the American-Association-for-Cancer-Research (AACR), Illinois, Amerika Birleşik Devletleri, 14 - 18 Nisan 2018, cilt.78, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

2017

2017

6. APA isoform diversity in triple negative breast cancers

AKMAN TUNCER H. B., ÖYKEN M., AĞUŞ H. H., ERDEM M., YAVUZ E., CAN T., et al.

AACR Annual Meeting, USA, Washington, Amerika Birleşik Devletleri, 1 - 05 Nisan 2017, cilt.77, ss.3374, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

2016

2016

7. Identification of a potential cancer related lncRNA

BEĞİK O., cinkilli t., ÖYKEN M., CAN T., ERSON BENSAN A. E.

Functional Genomics to Systems Biology-EMBO, 12 - 15 Kasım 2016 Sürdürülebilir Kalkınma

2016

2016

8. Comparison of tissue disease specific integrated networks using directed graphlet signatures

SÖNMEZ A. B., CAN T.

Proceedings of the 7th ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics - BCB '16, Seattle, WA, USA, Amerika Birleşik Devletleri, 2 - 05 Ekim 2016

2016

2016

10. 3 ' UTR lengths change in connection with estrogen receptor-alpha in breast cancer

ÖYKEN M., CAN T., Erson-Bensan A. E.

41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.207, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

2015

2015

11. Unsupervised identification of redundant domain entries in InterPro database using clustering techniques

RİFAİOĞLU A. S., DOĞAN T., CAN T.

6th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics, BCB 2015, Georgia, Amerika Birleşik Devletleri, 9 - 12 Eylül 2015, ss.505-506, (Tam Metin Bildiri) identifier

2015

2015

12. Reconstruction of the Temporal Signaling Network in Salmonella Infected Human Cells

güngör b., EREN ÖZSOY Ö., AYDIN SON Y., CAN T., nurcan t.

23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 14th European Conference on Computational Biology (ISMBECCB’2015), Dublin, İrlanda, 10 - 14 Temmuz 2015

2013

2013

13. Dbchem A database query based solution for the chemical compound and drug name recognition task

ATA Ç., CAN T.

Proceedings of the Fourth BioCreative Challenge Evaluation Workshop, BioCreative IV,, 1 - 03 Ekim 2013, cilt.2, ss.42-46, (Tam Metin Bildiri)

2012

2012

14. M4B: A novel method for designing and ordering of the genetic devices

Hashemikhabir S., Ersoy G., Oguz G., Yaldiz B., Tuncel Y., Budak G., et al.

2012 7th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, HIBIT 2012, Cappadocia, Türkiye, 19 - 22 Nisan 2012, ss.123-127, (Tam Metin Bildiri) identifier

2011

2011

15. Parallel SPICi

Hashemikhabir S., CAN T.

6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), İzmir, Türkiye, 2 - 05 Mayıs 2011, ss.86-90, (Tam Metin Bildiri) identifier

2011

2011

16. CONSTRUCTING SIGNALING PATHWAYS FROM RNAI DATA USING GENETIC ALGORITHMS

Ayaz E. S., CAN T.

6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), İzmir, Türkiye, 2 - 05 Mayıs 2011, ss.95-98, (Tam Metin Bildiri) identifier

2011

2011

17. The effect of representative training dataset selection on the classification performance of the promoter sequences

YAMAN A. G., CAN T.

6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, HIBIT 2011, İzmir, Türkiye, 2 - 05 Mayıs 2011, ss.55-58, (Tam Metin Bildiri) identifier identifier

2010

2010

18. Coevolution based prediction of protein-protein interactions with reduced training data

Pamuk B., CAN T.

2010 5th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, HIBIT 2010, Antalya, Türkiye, 20 - 22 Nisan 2010, ss.187-193, (Tam Metin Bildiri) Creative Commons License identifier

2009

2009

19. Text Classification in the Turkish Marketing Domain for Context Sensitive Ad Distribution

Engin M., Can T.

24th International Symposium on Computer and Information Sciences, Güzelyurt, Kıbrıs (Kktc), 14 - 16 Eylül 2009, ss.105-110, (Tam Metin Bildiri) identifier identifier

2008

2008

20. Human Skeletal and Muscle Deformation Animation Using Motion Capture Data

Bayer A. O., Sevinc A. M., CAN T.

16th International Conference in Central Europe on Computer Graphics, Visualization and Computer Vision, Plzen, Çek Cumhuriyeti, 4 - 07 Şubat 2008, ss.167-168, (Tam Metin Bildiri) identifier

2005

2005

21. Analysis of protein-protein interaction networks using random walks

Can T., Orhan Ç., Singh A. K.

5th International Workshop on Bioinformatics, BIOKDD 2005 - In Conjunction with 11th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, KDD 2005, Chicago, IL, Amerika Birleşik Devletleri, 21 Ağustos 2005, ss.61-68, (Tam Metin Bildiri) identifier

2003

2003

22. CTSS: A robust and efficient method for protein structure alignment based on local geometrical and biological features

Can T., WANG Y.

2nd International Computational Systems Bioinformatics Conference, California, Amerika Birleşik Devletleri, 11 - 14 Ağustos 2003, ss.169-179, (Tam Metin Bildiri) identifier identifier

Kitaplar

2015

2015

1. Hastalıkların Genetik Temellerinin Tanımlanması

KAYA Z., SON Ç. D., KANDEMİR İ., AKKAYA A., AYDIN SON Y., CAN T., et al.

Biyologlar için biyoenformatik, Zeki Kaya, Editör, Nobel, Ankara, ss.3-22, 2015

2013

2013

2. Introduction to Bioinformatics

CAN T.

miRNomics MicroRNA Biology and Computational Analysis, Yousef Malik, Allmer Jens, Editör, Springer Protocols, ss.51-71, 2013

Desteklenen Projeler

2021 - 2022

2021 - 2022

Genom Düzeyindeki Protein Bağlanma Verilerinin Biyoinformatik ve Deneysel Yöntemlerle Analizi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

MUYAN M. (Yürütücü), DEMİRALAY Ö. D., CAN T.

2017 - 2019

2017 - 2019

Yaygın kanser tiplerinde transkriptom 3'UTR isoform çeşitliliğinin incelenmesiSürdürülebilir Kalkınma

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

ERSON BENSAN A. E. (Yürütücü), GÜLEZ B., BANERJEE S., ÖZKAN S., CAN T.

2010 - 2019

2010 - 2019

G-Proteini Kenetli Reseptörlerin Etkileşimleri:hesaplamalı Yöntemlerin Ve Deneysel Çalışmaların Sentezlenmesi.

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

CAN T. (Yürütücü)

2017 - 2017

2017 - 2017

G-proteine kenetli reseptörlerin etkileşim bölgelerinin işlemsel olarak 3D modellenmesi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

SON Ç. D. (Yürütücü), ÇELEBİ M., CAN T.

2015 - 2016

2015 - 2016

Meme Kanseri Model Hücrelerinde Tüm Genom Düzeyinde RNA Ekspresyon AnalizleriSürdürülebilir Kalkınma

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

MUYAN M. (Yürütücü), ERSON BENSAN A. E., CAN T.

2013 - 2015

2013 - 2015

CDC6 alternatif poliadenilasyonunun meme kanseri hücrelerinde incelenmesiSürdürülebilir Kalkınma

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

ERSON BENSAN A. E. (Yürütücü), ozdemir n., CAN T.

Patent

2016

2016

APADetect: Alternatif Poliadenilasyon Tespiti

Patent

Standart Tescil



Atıflar

Toplam Atıf Sayısı (WOS): 692

h-indeksi (WOS): 13