Prof. Dr. TOLGA CAN


Enformatik Enstitüsü, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü


WoS Araştırma Alanları: Bilgisayar Bilimi Bilgi Sistemleri, Yaşam Bilimleri (Life), Bilgisayar Bilimi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Bilgisayar Bilimi İnterdisipliner Uygulamalar, Mühendislik Bilişim Ve Teknoloji (Eng)


Scopus Araştırma Alanları: Bilgi sistemi, Genel Bilgisayar Bilimi, Moleküler Biyoloji, Bilgisayar Grafikleri ve Bilgisayar Destekli Tasarım


Avesis Araştırma Alanları: Bilgisayar Bilimleri, Biyoenformatik, Mühendislik ve Teknoloji

Araştırmacı kurumdan ayrılmıştır

E-posta: tcan@metu.edu.tr
İş Telefonu: +90 312 210 2080 Dahili: 2080
Fax Telefonu: +90 312 210 5544
Web: http://user.ceng.metu.edu.tr/~tcan/
Ofis: Bilgisayar Muhendisligi B-109

Metrikler

Yayın

57

Yayın (WoS)

42

Yayın (Scopus)

40

Atıf (WoS)

695

H-İndeks (WoS)

13

Atıf (Scopus)

730

H-İndeks (Scopus)

14

Atıf (Scholar)

146

H-İndeks (Scholar)

6

Proje

14

Fikri Mülkiyet

1

Tez Danışmanlığı

36

Açık Erişim

48
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Biyografi

Tolga Can, 1998 yılında Orta Doğu Teknik Üniversitesi'nden Bilgisayar Mühendisliği lisans derecesini, 1998 yılında University of California, Santa Barbara'dan Bilgisayar Bilimi alanında doktora derecesini aldı. Halen Orta Doğu Teknik Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği bölümünde profesördür. Başlıca araştırma alanları arasında biyoenformatik ve algoritmalar yer almaktadır. Protein yapısı görselleştirme ve hizalaması ve büyük ölçekli protein-protein etkileşim ağlarının oluşturulması ve analizi üzerinde çalışmaları vardır.

Eğitim Bilgileri

2000 - 2004

2000 - 2004

Doktora

University of California, Santa Barbara, Bilgisayar Bilimleri, Amerika Birleşik Devletleri

1994 - 1998

1994 - 1998

Lisans

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü, Türkiye

Araştırma Alanları

Bilgisayar Bilimleri

Biyoenformatik

Mühendislik ve Teknoloji

Akademik Faaliyetlere Dayalı Araştırma Alanları

Avesis Araştırma Alanları

    WoS Araştırma Alanları

      Scopus Araştırma Alanları

        Akademik Ünvanlar / Görevler

        2017 - Devam Ediyor

        2017 - Devam Ediyor

        Prof. Dr.

        Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

        2011 - 2017

        2011 - 2017

        Doç. Dr.

        Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

        2007 - 2011

        2007 - 2011

        Yrd. Doç. Dr.

        Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

        2006 - 2007

        2006 - 2007

        Öğretim Görevlisi

        Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

        2000 - 2005

        2000 - 2005

        Araştırma Görevlisi

        University of California, Santa Barbara, College Of Engineering, Computer Science

        Yönetimsel Görevler

        2007 - 2010

        2007 - 2010

        Bölüm Başkan Yardımcısı

        Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

        Akademi Dışı Deneyim

        2007 - Devam Ediyor

        2007 - Devam Ediyor

        Assistant Professor

        METU, Assistant Professor

        2006 - 2007

        2006 - 2007

        Instructor/Reader

        METU, Instructor/Reader

        2004 - 2005

        2004 - 2005

        Postdoctoral Researcher

        University of California, Santa Barbara, Postdoctoral Researcher

        2001 - 2004

        2001 - 2004

        Assistant

        University of California, Santa Barbara, Assistant

        1998 - 2000

        1998 - 2000

        Assistant

        METU, Assistant

        Yönetilen Tezler

        2019

        2019

        Yüksek Lisans

        Şehiriçi sürüş senaryoları için mini otonom araç mimarisi.

        CAN T. (Danışman)

        G.Karabulut(Öğrenci) Creative Commons License

        2017

        2017

        Yüksek Lisans

        A layout algorithm for visualization of graph alignments

        CAN T. (Danışman)

        A.AKARSU(Öğrenci) Creative Commons License

        2014

        2014

        Yüksek Lisans

        Modeling of split step parabolic wave equation using the graphics processing unit

        CAN T. (Eş Danışman), ŞENER C. (Eş Danışman)

        S.SEKMEN(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

        2014

        2014

        Yüksek Lisans

        GPU accelerated radio wave propagation modeling using ray tracing

        CAN T. (Eş Danışman), ŞENER C. (Eş Danışman)

        A.ZUBAROĞLU(Öğrenci) Creative Commons License

        2013

        2013

        Yüksek Lisans

        Analysis of 3'UTR shortening events in breast cancer

        CAN T. (Danışman)

        O.BALOĞLU(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

        2013

        2013

        Yüksek Lisans

        A framework for gene co-expression network analysis of lung cancer

        CAN T. (Eş Danışman), AYDIN SON Y. (Eş Danışman)

        E.AKDEMİR(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

        2011

        2011

        Yüksek Lisans

        Parallelization of functional flow to predict protein functions

        CAN T. (Danışman)

        E.AKKOYUN(Öğrenci) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma

        2011

        2011

        Yüksek Lisans

        Machine learning methods for promoter region prediction

        CAN T. (Danışman)

        H.ARSLAN(Öğrenci) Creative Commons License

        2010

        2010

        Yüksek Lisans

        A distributed graph mining framework based on mapreduce

        CAN T. (Danışman)

        S.ALKAN(Öğrenci) Creative Commons License

        2010

        2010

        Yüksek Lisans

        A 3D topological tracking system for augmented reality

        CAN T. (Danışman)

        M.ERCAN(Öğrenci) Creative Commons License

        2007

        2007

        Yüksek Lisans

        A classification system for the problem of protein subcellular localization

        CAN T. (Eş Danışman), ATALAY M. V. (Eş Danışman)

        G.ALAY(Öğrenci) Creative Commons License

        Makaleler

        Tümü (33)
        SCI-E, SSCI, AHCI (32)
        SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (32)
        Scopus (32)
        Diğer Yayınlar (1)

        Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

        2021

        2021

        1. HNRNPA1 Isoform Switch in Breast Cancer

        ÖZGÜL İ., Erdem M., Döken D. N., GÜRCÜOĞLU I., GÜNTEKİN ERGÜN S., Cetin Atalay R., et al.

        Frontiers in Cancer Science 2021, Singapur, 1 - 03 Kasım 2021, cilt.1, ss.28, (Özet Bildiri)

        2018

        2018

        2. Transcription Elongation in Connection to 3’UTR Ends

        ÖZGÜL İ., CAN T., ERSON BENSAN A. E.

        Moleküler Biyoloji Kongresi MolBiyoKON18, İzmir, Türkiye, 5 - 08 Eylül 2018, ss.20, (Özet Bildiri)

        2018

        2018

        3. Deregulated APA and cancer specific APA isoforms

        Begik O., Ercan M., Cingoz H., CAN T., ÖYKEN M., Erson-Bensan A. E.

        Annual Meeting of the American-Association-for-Cancer-Research (AACR), Illinois, Amerika Birleşik Devletleri, 14 - 18 Nisan 2018, cilt.78, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

        2017

        2017

        6. APA isoform diversity in triple negative breast cancers

        AKMAN TUNCER H. B., ÖYKEN M., AĞUŞ H. H., ERDEM M., YAVUZ E., CAN T., et al.

        AACR Annual Meeting, USA, Washington, Amerika Birleşik Devletleri, 1 - 05 Nisan 2017, cilt.77, ss.3374, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

        2016

        2016

        7. Identification of a potential cancer related lncRNA

        BEĞİK O., cinkilli t., ÖYKEN M., CAN T., ERSON BENSAN A. E.

        Functional Genomics to Systems Biology-EMBO, 12 - 15 Kasım 2016 Sürdürülebilir Kalkınma

        2016

        2016

        8. Comparison of tissue disease specific integrated networks using directed graphlet signatures

        SÖNMEZ A. B., CAN T.

        Proceedings of the 7th ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics - BCB '16, Seattle, WA, USA, Amerika Birleşik Devletleri, 2 - 05 Ekim 2016

        2016

        2016

        10. 3 ' UTR lengths change in connection with estrogen receptor-alpha in breast cancer

        ÖYKEN M., CAN T., Erson-Bensan A. E.

        41st FEBS Congress on Molecular and Systems Biology for a Better Life, Kusadasi, Türkiye, 3 - 08 Eylül 2016, cilt.283, ss.207, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

        2015

        2015

        11. Unsupervised identification of redundant domain entries in InterPro database using clustering techniques

        RİFAİOĞLU A. S., DOĞAN T., CAN T.

        6th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics, BCB 2015, Georgia, Amerika Birleşik Devletleri, 9 - 12 Eylül 2015, ss.505-506, (Tam Metin Bildiri) identifier

        2015

        2015

        12. Reconstruction of the Temporal Signaling Network in Salmonella Infected Human Cells

        güngör b., EREN ÖZSOY Ö., AYDIN SON Y., CAN T., nurcan t.

        23rd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 14th European Conference on Computational Biology (ISMBECCB’2015), Dublin, İrlanda, 10 - 14 Temmuz 2015

        2013

        2013

        13. Dbchem A database query based solution for the chemical compound and drug name recognition task

        ATA Ç., CAN T.

        Proceedings of the Fourth BioCreative Challenge Evaluation Workshop, BioCreative IV,, 1 - 03 Ekim 2013, cilt.2, ss.42-46, (Tam Metin Bildiri)

        2012

        2012

        14. M4B: A novel method for designing and ordering of the genetic devices

        Hashemikhabir S., Ersoy G., Oguz G., Yaldiz B., Tuncel Y., Budak G., et al.

        2012 7th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, HIBIT 2012, Cappadocia, Türkiye, 19 - 22 Nisan 2012, ss.123-127, (Tam Metin Bildiri) identifier

        2011

        2011

        15. Parallel SPICi

        Hashemikhabir S., CAN T.

        6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), İzmir, Türkiye, 2 - 05 Mayıs 2011, ss.86-90, (Tam Metin Bildiri) identifier

        2011

        2011

        16. CONSTRUCTING SIGNALING PATHWAYS FROM RNAI DATA USING GENETIC ALGORITHMS

        Ayaz E. S., CAN T.

        6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), İzmir, Türkiye, 2 - 05 Mayıs 2011, ss.95-98, (Tam Metin Bildiri) identifier

        2011

        2011

        17. The effect of representative training dataset selection on the classification performance of the promoter sequences

        YAMAN A. G., CAN T.

        6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, HIBIT 2011, İzmir, Türkiye, 2 - 05 Mayıs 2011, ss.55-58, (Tam Metin Bildiri) identifier identifier

        2010

        2010

        18. Coevolution based prediction of protein-protein interactions with reduced training data

        Pamuk B., CAN T.

        2010 5th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, HIBIT 2010, Antalya, Türkiye, 20 - 22 Nisan 2010, ss.187-193, (Tam Metin Bildiri) Creative Commons License identifier

        2009

        2009

        19. Text Classification in the Turkish Marketing Domain for Context Sensitive Ad Distribution

        Engin M., Can T.

        24th International Symposium on Computer and Information Sciences, Güzelyurt, Kıbrıs (Kktc), 14 - 16 Eylül 2009, ss.105-110, (Tam Metin Bildiri) identifier identifier

        2008

        2008

        20. Human Skeletal and Muscle Deformation Animation Using Motion Capture Data

        Bayer A. O., Sevinc A. M., CAN T.

        16th International Conference in Central Europe on Computer Graphics, Visualization and Computer Vision, Plzen, Çek Cumhuriyeti, 4 - 07 Şubat 2008, ss.167-168, (Tam Metin Bildiri) identifier

        2005

        2005

        21. Analysis of protein-protein interaction networks using random walks

        Can T., Orhan Ç., Singh A. K.

        5th International Workshop on Bioinformatics, BIOKDD 2005 - In Conjunction with 11th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining, KDD 2005, Chicago, IL, Amerika Birleşik Devletleri, 21 Ağustos 2005, ss.61-68, (Tam Metin Bildiri) identifier

        2003

        2003

        22. CTSS: A robust and efficient method for protein structure alignment based on local geometrical and biological features

        Can T., WANG Y.

        2nd International Computational Systems Bioinformatics Conference, California, Amerika Birleşik Devletleri, 11 - 14 Ağustos 2003, ss.169-179, (Tam Metin Bildiri) identifier identifier

        Kitaplar

        2015

        2015

        1. Hastalıkların Genetik Temellerinin Tanımlanması

        KAYA Z., SON Ç. D., KANDEMİR İ., AKKAYA A., AYDIN SON Y., CAN T., et al.

        Biyologlar için biyoenformatik, Zeki Kaya, Editör, Nobel, Ankara, ss.3-22, 2015

        2013

        2013

        2. Introduction to Bioinformatics

        CAN T.

        miRNomics MicroRNA Biology and Computational Analysis, Yousef Malik, Allmer Jens, Editör, Springer Protocols, ss.51-71, 2013

        Desteklenen Projeler

        2021 - 2022

        2021 - 2022

        Genom Düzeyindeki Protein Bağlanma Verilerinin Biyoinformatik ve Deneysel Yöntemlerle Analizi

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

        MUYAN M. (Yürütücü), DEMİRALAY Ö. D., CAN T.

        2017 - 2019

        2017 - 2019

        Yaygın kanser tiplerinde transkriptom 3'UTR isoform çeşitliliğinin incelenmesiSürdürülebilir Kalkınma

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

        ERSON BENSAN A. E. (Yürütücü), GÜLEZ B., BANERJEE S., ÖZKAN S., CAN T.

        2010 - 2019

        2010 - 2019

        G-Proteini Kenetli Reseptörlerin Etkileşimleri:hesaplamalı Yöntemlerin Ve Deneysel Çalışmaların Sentezlenmesi.

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi

        CAN T. (Yürütücü)

        2017 - 2017

        2017 - 2017

        G-proteine kenetli reseptörlerin etkileşim bölgelerinin işlemsel olarak 3D modellenmesi

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

        SON Ç. D. (Yürütücü), ÇELEBİ M., CAN T.

        2015 - 2016

        2015 - 2016

        Meme Kanseri Model Hücrelerinde Tüm Genom Düzeyinde RNA Ekspresyon AnalizleriSürdürülebilir Kalkınma

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

        MUYAN M. (Yürütücü), ERSON BENSAN A. E., CAN T.

        2013 - 2015

        2013 - 2015

        CDC6 alternatif poliadenilasyonunun meme kanseri hücrelerinde incelenmesiSürdürülebilir Kalkınma

        Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

        ERSON BENSAN A. E. (Yürütücü), ozdemir n., CAN T.

        Patent

        2016

        2016

        APADetect: Alternatif Poliadenilasyon Tespiti

        Patent

        Standart Tescil

        

        Atıflar

        Toplam Atıf Sayısı (WOS): 699

        h-indeksi (WOS): 13