Dr.Öğr.Üyesi AYBAR CAN ACAR

Eğitim Bilgileri

2002 - 2008

Doktora

George Mason University, Bilgisayar Bilimi (Computer Science), Amerika Birleşik Devletleri

1999 - 2001

Yüksek Lisans

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği (Yl) (Tezli), Türkiye

1995 - 1999

Lisans

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, Türkiye

Yaptığı Tezler

2008

Doktora

Query consolidation: Interpreting queries sent to independent heterogenous databases

George Mason University, Bilgisayar Bilimi (Computer Science)

2001

Yüksek Lisans

Synthesis, modification and characterization of sodalites

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği (Yl) (Tezli)

Araştırma Alanları

Biyoenformatik, Veritabanı Sistemleri , Yapay Zeka, Bilgisayarda Öğrenme ve Örüntü Tanıma, Belirsizlik Yönetimi , Bilgisayar Öğrenimi, Biyoinformatik, Biyolojik Modelleme, Biyolojik Veritabanları

Akademik Unvanlar / Görevler

2018 - Devam Ediyor

Dr.Öğr.Üyesi

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı

2012 - 2018

Yrd.Doç.Dr.

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı

2009 - 2012

Öğretim Görevlisi

İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

2002 - 2008

Araştırma Görevlisi

George Mason University

2001 - 2002

Araştırma Görevlisi

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Bilişim Araştırma Merkezi

1999 - 2001

Araştırma Görevlisi

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü

Yönetimsel Görevler

2016 - 2018

Anabilim/Bilim Dalı Başkanı

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Siber Güvenlik Anabilim Dalı

2012 - 2016

Program Koordinatörü

Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı

SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler

2020

The Use of Informed Priors in Biclustering of Gene Expression with the Hierarchical Dirichlet Process

Tercan B., Acar A. C.

IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, cilt.17, ss.1810-1821, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)

2020

iBioProVis: interactive visualization and analysis of compound bioactivity space

Dönmez A. , Rifaioğlu A. S. , Acar A. C. , Doğan T., Cetin-Atalay R., Atalay V.

BIOINFORMATICS, cilt.36, ss.4227-4230, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)

2020

Real-time Malaria Parasite Screening in Thick Blood Smears for Low-Resource Setting

Chibuta S., Acar A. C.

JOURNAL OF DIGITAL IMAGING, cilt.33, ss.763-775, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)

2020

Projecting the Course of COVID-19 in Turkey: A Probabilistic Modeling Approach

Acar A. C. , Er A. G. , Burduroğlu H. C. , Sülkü S. N. , Aydın Son Y. , Akın L., et al.

Turkish Journal Of Medical Sciences, cilt.0, 2020 (SCI Expanded İndekslerine Giren Dergi)

2020

Predicting abdominal aortic aneurysm growth using patient-oriented growth models with two-step Bayesian inference

Akkoyun E., Kwon S. T. , Acar A. C. , Lee W., Baek S.

COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, cilt.117, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)

2011

mESAdb: microRNA Expression and Sequence Analysis Database

Kaya K., Karakülah G., Yakicier C., Acar A. C. , Konu O.

NUCLEIC ACIDS RESEARCH, cilt.39, 2011 (SCI İndekslerine Giren Dergi)

2003

The synthesis and sodium-silver ion exchange of sodalites

Acar A. C. , Yucel H., Culfaz A.

CHEMICAL ENGINEERING COMMUNICATIONS, cilt.190, ss.861-882, 2003 (SCI İndekslerine Giren Dergi)

Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler

2020

Personalized Tumor Growth Prediction Using Multiscale Modeling

ÜNSAL S., Acar A. C. , Itik M., KABATAŞ A., GEDİKLİ Ö., ÖZDEMİR F., et al.

JOURNAL OF BASIC AND CLINICAL HEALTH SCIENCES, cilt.4, ss.347-363, 2020 (ESCI İndekslerine Giren Dergi)

Hakemli Kongre / Sempozyum Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar

2019

iBioProVis: Interactive Visualization and Analysis of Compound Bioactivity Space

Dönmez A., RİFAİOĞLU A. S. , ACAR A. C. , DOĞAN T., Martin M. J. , ATALAY R. , et al.

27th Conference on Intellient Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology, Basel, İsviçre, 21 - 25 Temmuz 2019

2015

COMBINATION THERAPY FOR HEPATOCELLULAR CARCINOMA: A SYSTEMS BIOLOGY PERSPECTIVE ON THE SYNERGISTIC ANTITUMOR ACTIVITY OF SORAFENIB WITH PI3K/AKT PATHWAY INHIBITORS

Erşahin T., Tunçbağ N. , Acar A. C. , Atalay R.

50th International Liver Congress of the European-Association-for-the-Study-of-the-Liver, Vienna, Avusturya, 22 - 26 Nisan 2015, cilt.62, ss.464

2019

Cross-Cultural Audiences and Their Perceptions of Music in a Biological Context: Transforming “Music Within” Art Installation into a Cross-Cultural Interface

Bozlak E., ACAR A. C. , SÜRER E.

International “Music and Sciences” Symposium, İstanbul, Türkiye, 17 - 19 Nisan 2019, ss.57

2018

Design and Evaluation of an Interactive Art Installation to Introduce 'de novo' Mutations to Different Audiences: "Music Within" Project

Bozlak E., ACAR A. C. , SÜRER E.

4th EAI International Conference on Smart Objects and Technologies for Social Good, Bologna, İtalya, 28 - 30 Kasım 2018, ss.82-87

2017

Gene mutations involved in drug resistance in liver cancer cells using a new rna-seq data analysis workflow

Guzelcan E. A. , Shojaei M., ACAR A. F. , ATALAY R.

42nd European-Society-for-Medical-Oncology Congress (ESMO), Madrid, İspanya, 8 - 12 Eylül 2017, cilt.28

2017

A framework for applying bioinformatics analysis of drug resistance to mathematical tumor models

ÜNSAL S., ACAR A. C. , İTİK M., KURT B., ÜNSAL Ü., TURHAN K.

NGS Tech Applications Congress: USA, Amerika Birleşik Devletleri, 25 - 26 Temmuz 2017

2017

A Method Proposal for Revealing Epigenetic Immune-Escape Mechanisms Using 450k Methylation Array Data

KASAP B., ÜNSAL S., AYDIN KASAP Z., ACAR A. C. , TURHAN K.

10. International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), 28 - 30 Haziran 2017

2017

Identification of Gene Mutations Involved in Drug Resistance in Liver Cancer Using Rna-Seq Data Analysis

Shojeai M., Akhan E., ACAR A. C. , ATALAY R.

The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, (HIBIT), 28 - 30 Haziran 2017

2017

Kişiselleştirilmiş Tıp Uygulamaları ve Bir Örnek

ÜNSAL S., ACAR A. C. , İTİK M., KABATAŞ A., GEDİKLİ Ö., TURHAN K.

Tıp Bilişiminde Yenilikler Sempozyumu, Türkiye, 25 Mart 2017

2011

Segmenting and Labeling Query Sequences in a Multidatabase Environment

Acar A. C. , Motro A.

Confederated International Workshops and Posters: EI2N plus NSF ICE, ICSP plus INBAST, ISDE, ORM, OTMA, SWWS plus MONET plus SeDeS, and VADER, Hersonissos, Yunanistan, 17 - 21 Ekim 2011, cilt.7044, ss.367-368

2009

Efficient discovery of join plans in schemaless data

ACAR A. C. , Motro A.

Proceedings of the 2009 International Database Engineering Applications Symposium on - IDEAS ’xx09, Cetraro - Calabria, Italy, 16 - 18 Eylül 2009

2008

Query Consolidation: Interpreting a Set of Independent Queries Using a Multidatabase Architecture in the Reverse Direction

ACAR A. C. , Motro A.

14th International Workshop on New Trends in Information Integration, VLDB-NTII 2008, 24 - 30 Ağustos 2008

2004

Why is this User Asking so Many Questions Explaining Sequences of Queries

ACAR A. C. , AMIHAI M.

18th Annual IFIP TC11/WG 11.3 Conference on Data and Applications Security, Sitges, İspanya, 25 - 28 Temmuz 2004

2004

Utility Based Resolution of Data Inconsistencies

MOTRO A., ANOKHIN P., ACAR A. C.

Proceedings of the International Workshop on Information Quality in Information Systems, 23th ACM SIGMOD International Conference on Management of Data, 13 - 18 Temmuz 2004

Kitap & Kitap Bölümleri

2010

Inferring User Goals from Sets of Independent Queries in a Multidatabase Environment

ACAR A. C. , MOTRO A.

Advances in Intelligent Information Systems, Zbigniew W Ras, Li-Shiang Tsay, Editör, Springer, Berlin, ss.225-243, 2010

Desteklenen Projeler

2020 - Devam Ediyor

Identification of deregulated metabolic networks in hepatocellular carcinoma

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

BANERJEE S. (Yürütücü) , ACAR A. C.

2016 - Devam Ediyor

Kanser Sistem Biyolojisi Laboratuvarı KanSiL

CB Strateji ve Bütçe Başkanlığı (Kalkınma Bakanlığı) Projesi

ACAR A. C. (Yürütücü)

2017 - 2020

LAP1B Proteininin Kas Hücrelerinin Transkripsiyonel Regülasyonundaki Rolünün Araştırılması

TÜBİTAK Projesi

Acar A. C. , Dinçer P. R. (Yürütücü)

2013 - 2019

MikroRNA-Transkripsiyon Faktörü Düzenleyici Ağlarının Gen İfade Verisinden Olasılıksal Tema Modelleri Kullanılarak Tanımlanması

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

ACAR A. C. (Yürütücü)

2015 - 2018

Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde Tedavi Sonrası Tümör Gelişim Sürecinin Modellenmesi ve Simülasyonu

TÜBİTAK Projesi

Acar A. C. , Turhan K.(Yürütücü)

Tasarım

Ocak 2018

Design and Evaluation of an Interactive Art Installation to Introduce ‘de novo’ Mutations to Different Audiences: “Music Within” Project

Grafiksel Tasarım / Kullanıcı Deneyimi Tasarımı

Bozlak E., Acar A. C. , Sürer E.

Kontrata Dayalı Araştırmalar

2016 - Devam Ediyor

KANSERLİ DOKULARIN MİKROSKOBİK GÖRÜNTÜLERİNİN HASTAYA ÖZGÜ TEDAVİ VE PROGNOZ BELİRLEME AMAÇLI ANALİZİ VE BU KONUDA YAZILIM GELİŞTİRİLMESİ İÇİN KANSER SİSTEM BİYOLOJİSİ LABORATUVARI

ACAR A. C.

Bilimsel Hakemlikler

Temmuz 2020

TÜBİTAK Projesi

1501 - Sanayi Ar-Ge Projeleri Destekleme Programı, TÜBİTAK, Türkiye

Eylül 2019