Eğitim Bilgileri
2002 - 2008
2002 - 2008Doktora
George Mason University, Bilgisayar Bilimi (Computer Science), Amerika Birleşik Devletleri
1999 - 2001
1999 - 2001Yüksek Lisans
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği (Yl) (Tezli), Türkiye
1995 - 1999
1995 - 1999Lisans
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2008
2008Doktora
Query consolidation: Interpreting queries sent to independent heterogenous databases
George Mason University, Bilgisayar Bilimi (Computer Science)
2001
2001Yüksek Lisans
Synthesis, modification and characterization of sodalites
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği (Yl) (Tezli)
Araştırma Alanları
Biyoenformatik, Veritabanı Sistemleri , Yapay Zeka, Bilgisayarda Öğrenme ve Örüntü Tanıma, Belirsizlik Yönetimi , Bilgisayar Öğrenimi, Biyoinformatik, Biyolojik Modelleme, Biyolojik Veritabanları
Akademik Unvanlar / Görevler
2018 - Devam Ediyor
2018 - Devam EdiyorDr.Öğr.Üyesi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı
2012 - 2018
2012 - 2018Yrd.Doç.Dr.
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı
2009 - 2012
2009 - 2012Öğretim Görevlisi
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü
2002 - 2008
2002 - 2008Araştırma Görevlisi
George Mason University
2001 - 2002
2001 - 2002Araştırma Görevlisi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Bilişim Araştırma Merkezi
1999 - 2001
1999 - 2001Araştırma Görevlisi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü
Yönetimsel Görevler
2016 - 2018
2016 - 2018Anabilim/Bilim Dalı Başkanı
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Siber Güvenlik Anabilim Dalı
2012 - 2016
2012 - 2016Program Koordinatörü
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı
SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2020
2020The Use of Informed Priors in Biclustering of Gene Expression with the Hierarchical Dirichlet Process
Tercan B., Acar A. C.
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, cilt.17, ss.1810-1821, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2020
2020iBioProVis: interactive visualization and analysis of compound bioactivity space
Dönmez A. , Rifaioğlu A. S. , Acar A. C. , Doğan T., Cetin-Atalay R., Atalay V.
BIOINFORMATICS, cilt.36, ss.4227-4230, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2020
2020Real-time Malaria Parasite Screening in Thick Blood Smears for Low-Resource Setting
Chibuta S., Acar A. C.
JOURNAL OF DIGITAL IMAGING, cilt.33, ss.763-775, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2020
2020Projecting the Course of COVID-19 in Turkey: A Probabilistic Modeling Approach
Acar A. C. , Er A. G. , Burduroğlu H. C. , Sülkü S. N. , Aydın Son Y. , Akın L., et al.
Turkish Journal Of Medical Sciences, cilt.0, 2020 (SCI Expanded İndekslerine Giren Dergi)
2020
2020Predicting abdominal aortic aneurysm growth using patient-oriented growth models with two-step Bayesian inference
Akkoyun E., Kwon S. T. , Acar A. C. , Lee W., Baek S.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, cilt.117, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2011
2011mESAdb: microRNA Expression and Sequence Analysis Database
Kaya K., Karakülah G., Yakicier C., Acar A. C. , Konu O.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, cilt.39, 2011 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
2003
2003The synthesis and sodium-silver ion exchange of sodalites
Acar A. C. , Yucel H., Culfaz A.
CHEMICAL ENGINEERING COMMUNICATIONS, cilt.190, ss.861-882, 2003 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2020
2020Personalized Tumor Growth Prediction Using Multiscale Modeling
ÜNSAL S., Acar A. C. , Itik M., KABATAŞ A., GEDİKLİ Ö., ÖZDEMİR F., et al.
JOURNAL OF BASIC AND CLINICAL HEALTH SCIENCES, cilt.4, ss.347-363, 2020 (ESCI İndekslerine Giren Dergi)
Hakemli Kongre / Sempozyum Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar
2019
2019iBioProVis: Interactive Visualization and Analysis of Compound Bioactivity Space
Dönmez A., RİFAİOĞLU A. S. , ACAR A. C. , DOĞAN T., Martin M. J. , ATALAY R. , et al.
27th Conference on Intellient Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology, Basel, İsviçre, 21 - 25 Temmuz 2019
2015
2015COMBINATION THERAPY FOR HEPATOCELLULAR CARCINOMA: A SYSTEMS BIOLOGY PERSPECTIVE ON THE SYNERGISTIC ANTITUMOR ACTIVITY OF SORAFENIB WITH PI3K/AKT PATHWAY INHIBITORS
Erşahin T., Tunçbağ N. , Acar A. C. , Atalay R.
50th International Liver Congress of the European-Association-for-the-Study-of-the-Liver, Vienna, Avusturya, 22 - 26 Nisan 2015, cilt.62, ss.464
2019
2019Cross-Cultural Audiences and Their Perceptions of Music in a Biological Context: Transforming “Music Within” Art Installation into a Cross-Cultural Interface
Bozlak E., ACAR A. C. , SÜRER E.
International “Music and Sciences” Symposium, İstanbul, Türkiye, 17 - 19 Nisan 2019, ss.57
2018
2018Design and Evaluation of an Interactive Art Installation to Introduce 'de novo' Mutations to Different Audiences: "Music Within" Project
Bozlak E., ACAR A. C. , SÜRER E.
4th EAI International Conference on Smart Objects and Technologies for Social Good, Bologna, İtalya, 28 - 30 Kasım 2018, ss.82-87
2017
2017Gene mutations involved in drug resistance in liver cancer cells using a new rna-seq data analysis workflow
Guzelcan E. A. , Shojaei M., ACAR A. F. , ATALAY R.
42nd European-Society-for-Medical-Oncology Congress (ESMO), Madrid, İspanya, 8 - 12 Eylül 2017, cilt.28
2017
2017A framework for applying bioinformatics analysis of drug resistance to mathematical tumor models
ÜNSAL S., ACAR A. C. , İTİK M., KURT B., ÜNSAL Ü., TURHAN K.
NGS Tech Applications Congress: USA, Amerika Birleşik Devletleri, 25 - 26 Temmuz 2017
2017
2017A Method Proposal for Revealing Epigenetic Immune-Escape Mechanisms Using 450k Methylation Array Data
KASAP B., ÜNSAL S., AYDIN KASAP Z., ACAR A. C. , TURHAN K.
10. International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), 28 - 30 Haziran 2017
2017
2017Identification of Gene Mutations Involved in Drug Resistance in Liver Cancer Using Rna-Seq Data Analysis
Shojeai M., Akhan E., ACAR A. C. , ATALAY R.
The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, (HIBIT), 28 - 30 Haziran 2017
2017
2017Kişiselleştirilmiş Tıp Uygulamaları ve Bir Örnek
ÜNSAL S., ACAR A. C. , İTİK M., KABATAŞ A., GEDİKLİ Ö., TURHAN K.
Tıp Bilişiminde Yenilikler Sempozyumu, Türkiye, 25 Mart 2017
2011
2011Segmenting and Labeling Query Sequences in a Multidatabase Environment
Acar A. C. , Motro A.
Confederated International Workshops and Posters: EI2N plus NSF ICE, ICSP plus INBAST, ISDE, ORM, OTMA, SWWS plus MONET plus SeDeS, and VADER, Hersonissos, Yunanistan, 17 - 21 Ekim 2011, cilt.7044, ss.367-368
2009
2009Efficient discovery of join plans in schemaless data
ACAR A. C. , Motro A.
Proceedings of the 2009 International Database Engineering Applications Symposium on - IDEAS ’xx09, Cetraro - Calabria, Italy, 16 - 18 Eylül 2009
2008
2008Query Consolidation: Interpreting a Set of Independent Queries Using a Multidatabase Architecture in the Reverse Direction
ACAR A. C. , Motro A.
14th International Workshop on New Trends in Information Integration, VLDB-NTII 2008, 24 - 30 Ağustos 2008
2004
2004Why is this User Asking so Many Questions Explaining Sequences of Queries
ACAR A. C. , AMIHAI M.
18th Annual IFIP TC11/WG 11.3 Conference on Data and Applications Security, Sitges, İspanya, 25 - 28 Temmuz 2004
2004
2004Utility Based Resolution of Data Inconsistencies
MOTRO A., ANOKHIN P., ACAR A. C.
Proceedings of the International Workshop on Information Quality in Information Systems, 23th ACM SIGMOD International Conference on Management of Data, 13 - 18 Temmuz 2004
Kitap & Kitap Bölümleri
2010
2010Inferring User Goals from Sets of Independent Queries in a Multidatabase Environment
ACAR A. C. , MOTRO A.
Advances in Intelligent Information Systems, Zbigniew W Ras, Li-Shiang Tsay, Editör, Springer, Berlin, ss.225-243, 2010
Desteklenen Projeler
2020 - Devam Ediyor
2020 - Devam EdiyorIdentification of deregulated metabolic networks in hepatocellular carcinoma
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
BANERJEE S. (Yürütücü) , ACAR A. C.
2016 - Devam Ediyor
2016 - Devam EdiyorKanser Sistem Biyolojisi Laboratuvarı KanSiL
CB Strateji ve Bütçe Başkanlığı (Kalkınma Bakanlığı) Projesi
ACAR A. C. (Yürütücü)
2017 - 2020
2017 - 2020LAP1B Proteininin Kas Hücrelerinin Transkripsiyonel Regülasyonundaki Rolünün Araştırılması
TÜBİTAK Projesi
Acar A. C. , Dinçer P. R. (Yürütücü)
2013 - 2019
2013 - 2019MikroRNA-Transkripsiyon Faktörü Düzenleyici Ağlarının Gen İfade Verisinden Olasılıksal Tema Modelleri Kullanılarak Tanımlanması
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
ACAR A. C. (Yürütücü)
2015 - 2018
2015 - 2018Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde Tedavi Sonrası Tümör Gelişim Sürecinin Modellenmesi ve Simülasyonu
TÜBİTAK Projesi
Acar A. C. , Turhan K.(Yürütücü)
Tasarım
Ocak 2018
Ocak 2018Design and Evaluation of an Interactive Art Installation to Introduce ‘de novo’ Mutations to Different Audiences: “Music Within” Project
Grafiksel Tasarım / Kullanıcı Deneyimi Tasarımı
Bozlak E., Acar A. C. , Sürer E.
Kontrata Dayalı Araştırmalar
2016 - Devam Ediyor
2016 - Devam EdiyorKANSERLİ DOKULARIN MİKROSKOBİK GÖRÜNTÜLERİNİN HASTAYA ÖZGÜ TEDAVİ VE PROGNOZ BELİRLEME AMAÇLI ANALİZİ VE BU KONUDA YAZILIM GELİŞTİRİLMESİ İÇİN KANSER SİSTEM BİYOLOJİSİ LABORATUVARI
ACAR A. C.
Bilimsel Hakemlikler
Temmuz 2020
Temmuz 2020TÜBİTAK Projesi
1501 - Sanayi Ar-Ge Projeleri Destekleme Programı, TÜBİTAK, Türkiye
Eylül 2019
Eylül 2019TÜBİTAK Projesi
1507 - TÜBİTAK KOBİ Ar-Ge Başlangıç Destek Programı, B2METRİK YAZILIM VE BİLİŞİM LİMİTED ŞİRKETİ (İSTANBUL), Türkiye
Ekim 2018
Ekim 2018IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS
SCI-E Kapsamındaki Dergi
Etkinlik Organizasyonlarındaki Görevler
Eylül 2013
Eylül 20138th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
Bilimsel Kongre / Sempozyum Organizasyonu
Acar A. C. , Atalay R.
Ankara, Türkiye
Davetli Kongre ve Sempozyum Faaliyetleri
2017
201710th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
Davetli Konuşmacı
Güzelyurt-Kıbrıs (Kktc)
2015
20154th International Congress of the Molecular Biology Association of Turkey
Davetli Konuşmacı
Ankara-Türkiye
Davetli Konuşmalar
Kasım 2020
Kasım 2020Probabilistic Programming and Bayesian Inference in Biomedicine
Seminer
Sabancı Üniversitesi-Türkiye
Atıflar
Toplam Atıf Sayısı (WOS): 35
h-indeksi (WOS): 2
Bilimsel Araştırma / Çalışma Grubu Üyelikleri
2016 - Devam Ediyor
2016 - Devam Ediyor