Metrikler
Yayın
20
Açık Erişim
15
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Eğitim Bilgileri
1990 - 1994
1990 - 1994Doktora
University of Southern California, Electrical Engineering, Amerika Birleşik Devletleri
1987 - 1990
1987 - 1990Yüksek Lisans
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Ve Fen Bilimleri Enstitüsü, Elektrik Ve Elektronik Mühendisliği (Yl) (Tezli), Türkiye
1982 - 1987
1982 - 1987Lisans
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Elektrik-Elektronik Mühendisliği Bölümü, Türkiye
Yabancı Diller
B2 Orta Üstü
B2 Orta Üstüİngilizce
Araştırma Alanları
Biyomedikal Mühendisliği
Biyomedikal Görüntü İşleme
Mühendislik ve Teknoloji
Akademik Ünvanlar / Görevler
2013 - Devam Ediyor
2013 - Devam EdiyorProf. Dr.
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı
2008 - 2013
2008 - 2013Doç. Dr.
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Bilişim Sistemleri Anabilim Dalı
2002 - 2008
2002 - 2008Yrd. Doç. Dr.
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Bilişim Sistemleri Anabilim Dalı
Yönetimsel Görevler
2005 - 2008
2005 - 2008Anabilim/Bilim Dalı Başkanı
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı
Yönetilen Tezler
2022
2022Yüksek Lisans
A comparison of deep neural network architectures for COVID-19 detection using CT chest images
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
M.TUNAHAN(Öğrenci)
2022
2022Yüksek Lisans
An emotion recognition method with low spec ECG and EEG devices
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
E.KUTLU(Öğrenci)
2021
2021Yüksek Lisans
Automatic segmentation of mitochondria in scanning electron microscopy images
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
M.ÇAĞRI(Öğrenci)
2019
2019Doktora
B-mod ultrason görüntüleri üzerinde hassas sistem modeli kullanarak tek-görüntülü bayesçi onarma ve çok-görüntülü çözünürlük-üstü onarma.
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
M.Cüneyitoğlu(Öğrenci)
2019
2019Yüksek Lisans
Laparoskopik, endoskopik ve robotik cerrahide navigasyon (yön bulma) amacıyla derin öğrenme yaklaşımıyla organ yüzeyi oluşturma.
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
A.Zabardast(Öğrenci)
2017
2017Yüksek Lisans
Semi-automatic segmentation of mitochondria on transmission electron microscopy images using live-wire and surface dragging methods
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
M.FARZIN(Öğrenci)
2016
2016Yüksek Lisans
Elektron mikroskobu görüntülerı üzerinde kalman filtreleme yaklaşımını kullanılarak yarı-otomatik mitokondri bölütleme.
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
A.Mohammadi(Öğrenci)
2016
2016Doktora
Detection and segmentation of mitochondria from electron microscope tomography images
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
F.SERDAR(Öğrenci)
2016
2016Yüksek Lisans
Automatic segmentation of cristae membranes in 3d electron microscopy tomography images using artificial neural networks
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
M.ALPHAN(Öğrenci)
2015
2015Yüksek Lisans
Semi-automatic/user-guided segmentation of mitochondria on transmission electron microscopy images
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
M.ÇÖÇELLİ(Öğrenci)
2013
2013Yüksek Lisans
Predicting the level of knee osteoarthritis by using dimension reduction techniques on time series features of gait data
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
S.CANER(Öğrenci)
2012
2012Yüksek Lisans
Analyses of factors affecting acceptance of homecare technologies by patients with chronic diseases
ÖZKAN YILDIRIM S. (Eş Danışman), MUMCUOĞLU Ü. E. (Eş Danışman)
A.KUTLAY(Öğrenci)
2012
2012Doktora
İnsan yüz dokularının bulanıklaşma, gürültü ve kısmi hacim modelleri içeren Bayesçi 3B MR-BT görüntü birleşmesi yöntemi kullanılarak otomatik bölütlenmesi.
KANOĞLU U. (Eş Danışman), MUMCUOĞLU Ü. E. (Eş Danışman)
E.Şener(Öğrenci)
2011
2011Yüksek Lisans
İnsan yüz kaslarının kesit kümesi ve bayesçi yöntemlerle manyetik rezonans ve bilgisayarlı tomografi verisi kullanılarak bölütlenmesi.
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
H.Emre(Öğrenci)
2006
2006Doktora
Protein dizilimlerinin homoloji sezimi ve sınıflandırma amaçlı bilişimsel gösterimi.
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
H.Oğul(Öğrenci)
2004
2004Yüksek Lisans
Ambulans servisi ulaşımını kolaylaştıran coğrafi bilgi sistemi uygulaması
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
B.Gülden(Öğrenci)
2004
2004Yüksek Lisans
Tıbbi görüntüler için etkileşimli hacim kaplama.
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
K.Orhun(Öğrenci)
2004
2004Yüksek Lisans
Acil servis ambulansı için taşınabilir hasta veri toplama ve iletimi sisteminin tasarımı ve uygulaması
MUMCUOĞLU Ü. E. (Danışman)
E.Kösen(Öğrenci)
2003
2003Yüksek Lisans
Fcm ve k-means kümeleme algoritmaları kullanılarak mikro-dizin imgelerinin analizi
MUMCUOĞLU Ü. E. (Eş Danışman), Mumcuoğlu Ü.(Eş Danışman)
E.Ergüt(Öğrenci)
Makaleler
Tümü (15)
SCI-E, SSCI, AHCI (15)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (15)
Scopus (15)
2019
20191. Single-image Bayesian Restoration and Multi-image Super-resolution Restoration for B-mode Ultrasound Using an Accurate System Model Involving Correlated Nature of the Speckle Noise.
Cüneyitoğlu Ö., Mumcuoğlu Ü. E., Sancak İ.
Ultrasonic imaging
, cilt.41, ss.368-386, 2019 (SCI-Expanded, Scopus)
2016
20162. A validated active contour method driven by parabolic arc model for detection and segmentation of mitochondria
Tasel S. F., Mumcuoglu E. U., Hassanpour R. Z., Perkins G.
JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY
, cilt.194, ss.253-271, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)
2016
20163. Bayesian segmentation of human facial tissue using 3D MR-CT information fusion, resolution enhancement and partial volume modelling
Şener E., Mumcuoglu E. U., Hamcan S.
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE
, cilt.124, ss.31-44, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)
2013
20134. Image Analysis for Cystic Fibrosis: Computer-Assisted Airway Wall and Vessel Measurements from Low-Dose, Limited Scan Lung CT Images
Mumcuoglu E. U., Long F. R., Castile R. G., Gurcan M. N.
JOURNAL OF DIGITAL IMAGING
, cilt.26, sa.1, ss.82-96, 2013 (SCI-Expanded, Scopus)
2012
20125. Automatic segmentation of human facial tissue by MRI-CT fusion: A feasibility study
Kale E. H., Mumcuoglu E. U., HAMCAN S.
COMPUTER METHODS AND PROGRAMS IN BIOMEDICINE
, cilt.108, sa.3, ss.1106-1120, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)
2012
20126. Computerized detection and segmentation of mitochondria on electron microscope images
Mumcuoglu E. U., Hassanpour R., Tasel S. F., Perkins G., Martone M. E., Gurcan M. N.
JOURNAL OF MICROSCOPY
, cilt.246, ss.248-265, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)
2011
20117. Computerized scar detection on renal cortical scintigraphy images
MUMCUOĞLU Ü. E., Bozkurt F. M., Aslan M., Sener E., UĞUR Ö.
NUCLEAR MEDICINE COMMUNICATIONS
, cilt.32, sa.11, ss.1070-1078, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)
2010
20108. Development of a Visio-Haptic Integrated Dental Training Simulation System
Konukseven E. İ., Önder M. E., Mumcuoğlu Ü. E., Kişnişçi R. S.
JOURNAL OF DENTAL EDUCATION
, cilt.74, ss.880-891, 2010 (SCI-Expanded, Scopus)
2007
20079. Subcellular localization prediction with new protein encoding schemes
Ogul H., Mumcuoglu E. U.
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS
, cilt.4, sa.2, ss.227-232, 2007 (SCI-Expanded, Scopus)
2007
200710. A discriminative method for remote homology detection based on n-peptide compositions with reduced amino acid alphabets
OĞUL H., Mumcuoglu E. U.
BIOSYSTEMS
, cilt.87, sa.1, ss.75-81, 2007 (SCI-Expanded, Scopus)
2006
200611. Sampling of sentinel nodes: A simulation study
Celasun B., Mumcuoglu E. U., Kalkan H.
ANALYTICAL AND QUANTITATIVE CYTOLOGY AND HISTOLOGY
, cilt.28, sa.6, ss.346, 2006 (SCI-Expanded, Scopus)
2006
200612. SVM-based detection of distant protein structural relationships using pairwise probabilistic suffix trees
Ogul H., Mumcuoglu E. U.
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY
, cilt.30, sa.4, ss.292-299, 2006 (SCI-Expanded, Scopus)
2006
200613. Protein solvent accessibility prediction using support vector machines and sequence conservations
Ogul H., Mumcuoglu E. U.
ARTIFICIAL INTELLIGENCE AND NEURAL NETWORKS
, cilt.3949, ss.141-148, 2006 (SCI-Expanded, Scopus)
2005
200514. Discriminative remote homology detection using maximal unique sequence matches
OGUL H., Mumcuoglu U.
ADVANCES IN INTELLIGENT DATA ANALYSIS VI, PROCEEDINGS
, cilt.3646, ss.283-292, 2005 (SCI-Expanded, Scopus)
1994
199415. FAST GRADIENT-BASED METHODS FOR BAYESIAN RECONSTRUCTION OF TRANSMISSION AND EMISSION PET IMAGES
MUMCUOGLU E., LEAHY R., CHERRY S., ZHOU Z.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
, cilt.13, sa.4, ss.687-701, 1994 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2014
20141. Automatic detection of mitochondria from electron microscope tomography images: a curve fitting approach
Tasel S. F., HASSANPOUR R., Mumcuoglu E. U., Perkins G., Martone M.
Conference on Medical Imaging - Image Processing, California, Amerika Birleşik Devletleri, 16 - 18 Şubat 2014, cilt.9034, (Tam Metin Bildiri)
2009
20092. Image analysis for cystic fibrosis: Automatic lung airway wall and vessel measurement on CT images
MUMCUOĞLU Ü. E.
2009 Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, 3 - 06 Eylül 2009, (Tam Metin Bildiri)
1996
19963. Accurate geometric and physical response modelling for statistical image reconstruction in high resolution PET
MUMCUOĞLU Ü. E., LEAHY R. M., CHERRY S. R., HOFFMAN E.
IEEE Nuclear Science Symposium, 1996, California, Amerika Birleşik Devletleri, 2 - 09 Kasım 1996, cilt.3, ss.1569-1573, (Tam Metin Bildiri)
Kitaplar
2019
20191. Ultrasonik Tıbbi Görüntülemenin Temelleri ve Görüntü AnalizindeYeni Yaklaşımlar
Cüneyitoğlu Özkul M., MUMCUOĞLU Ü. E.
Biyomedikal Mühendisliği ve Uygulamaları, Eroğul Osman, Koçak Onur, Editör, TMMOB, EMO Ankara Şubesi, Ankara, ss.319-348, 2019
2018
20182. Chapter 13: Acceptance of Mobile Homecare Technologies: An Empirical Investigation on Patients with Chronic Diseases
Özkan Yıldırım S., Kutluay A., Mumcuoğlu Ü. E.
CURRENT AND EMERGING M-HEALTH TECHNOLOGIES, sezgin,e yıldırım,s,i yıldırım,s sümüer,e., Editör, Springer, London/Berlin , Berlin, ss.201-222, 2018
Desteklenen Projeler
2018 - 2019
2018 - 2019Serbest-el taramayla elde edilen B-modu ultrason videodan 3B hacimsel görüntü oluşturma, görüntü onarma, ters-evrişim ve çözünürlük-üstü uygulamalar
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
MUMCUOĞLU Ü. E. (Yürütücü), CÜNEYİTOĞLU ÖZKUL M.
2016 - 2016
2016 - 2016AĞIZ 3 BOYUTLU GÖRÜNTÜSÜNÜ DİŞ ŞABLONU İLE EŞLEŞTİREREK DURUM TESPİTİ YAPABİLECEK TANI VE TEŞHİS KOYMAYA DOĞRU AKILLI ÖĞRENME ÖZELLİKLERİ EKLENEN YAZILIM PLATFORMU GELİŞTİRİLMESİ
TÜBİTAK Projesi
MUMCUOĞLU Ü. E.
2014 - 2014
2014 - 2014Elektron Mikroskop Tomografisi Görüntülerinde Mitokondri Tespiti ve Bölütlemesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer
MUMCUOĞLU Ü. E. (Yürütücü), Taşel S. F.