Molecular characterization of multi-drug resistant salmonella isolates in Turkey
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2001
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: KUTLU GÖKSU ELPEK
Danışman: GÜLAY ÖZCENGİZ
Özet:oz TÜRKİYE'DEKİ ÇOKLU ANTİBİYOTİK DİRENÇLİLİĞİ GÖSTEREN SALMONELLA İZOLATLARININ MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONU Elpek, Kutlu Göksu Yüksek Lisans, Biyoteknoloji Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Gülay Özcengiz Yardımcı Tez Yöneticisi: Doç. Dr. Candan Gürakan Eylül, 2001, 90 sayfa Bu çalışmada, Türkiye kökenli Salmonella izolatları plazmid ve antibiyotik dirençliliği profilleri, kolisinojeni, lipopolisakkarit ve dış zar protein profilleri bakımından karakterize edilmiştir. Daha önce kolisinojeni dışındaki özellikleri bakımından karakterize edilmiş olan 82 S. enteritidis izolatında kolisin üretimi kloroform-yayma metodu ile test edilmiştir. Bu izolatlarda kolisin üretiminin yaygın olmadığı belirlenmiştir. Bu izolatlardan sadece biri (A 19; tavuk kökenli) kolisin üretmiştir. Daha önce plazmidleri ve antibiyotik dirençliliği bakımından analiz edilmiş olan ve çoklu ilaç dirençliliği gösteren 35 S. typhimuriıun izolatı kolisin üretimi, lipopolisakkarit ve dış zar protein profilleri bakımından karakterize edilmiştir. Bu izolatların 14'ünde (35%) kolisin üretimi gözlenmiştir. Bu izolatlarda lipopolisakkaritler, proteinase-K ile yıkım metodu ile elde edilmiş ve SDS-PAGEyöntemi kullanılarak incelenmiştir. Bütün izolatların düzgün (smooth) tip lipopolisakkarit içerdiği gösterilmiştir. Dış zar proteinleri sarkozil ekstraksiyonu ve SDS-PAGE yöntemleri ile incelenmiştir. Yirmialtı (74.3%) izolatta 30.4 ve 34.6 kDa, 3 (8.6%) izolatta sadece 30.6 kDa, 6 (17.1%) izolatta da 27.2, 30.6 ve 34.6 kDa ağırlığında dış zar proteinleri görülmüştür. İzolatların plazmid DNA profilleri, antibiyotik dirençlilikleri, kolisin üretimleri, lipopolisakarit ve dış zar proteini profilleri arasında bir bağlantı kurulamamıştır. Kolisin üreten, sefalotin (Ckf) ve piperasilin (Prl) dirençli lokal bir S. havana (H32) izolatınm 54, 28.4, 2.7 ve 1.9 kb ağırlığında plazmidler taşıdığı saptanmıştır. Bu izolatın plazmidleri yok edildiğinde kolisin üretimi, antibiyotik dirençlilikleri ve düzgün tip lipopolisakkarit özellikleri ve ayrıca ayrıca 34.6 kDa ağırlığındaki dış zar proteini kaybolmuştur. Bu izolatın plazmid içermeyen ve nalidiksik asit (Nal) dirençli türevi konjugasyon yoluyla plazmid transferi deneylerinde kullanılmıştır. Elde edilen 27 transkonjuganttan 10'u Nal ve Prl, 10'u Nal ve Ckf, 7'si de Nal, Prl ve Ckf dirençli olarak gözlenmiştir. Ckf dirençliliğinin 54 kb, Prl dirençliliğinin ise 28.4 kb ağırlığındaki plazmidlerle belirlendiği saptanmıştır. Transkonjugantlarda plazmid içeriği ile kolisin üretimi, lipopolisakkarit ve dış zar protein profilleri arasında bir bağlantı olmadığı gösterilmiştir. Anahtar kelimeler: S. enteritidis, S. typhimurium, S. havana, çoklu antibiyotik dirençliliği (antibiyogram), Plasmit profil analizi, Kolisin üretimi, Lipopolisakkarit (LPS) profili, Dış zar protein (OMP) profili. vı