Enzymatic synthesis of novel dipeptides
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2002
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: IŞIL TÜZÜN
Danışman: GÜLAY ÖZCENGİZ
Özet:öz YENİ DİPEPTİDLERİN ENZIMATTK SENTEZİ TÜZÜN, Işıl Yüksek Lisans Tezi, Biyoloji Anabilim Dalı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Gülay Özcengiz Ortak Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Ayhan S. Demir Eylül 2002, 73 sayfa Basilisin, Bacillus subtilis'in bazı suşları tarafından üretilen ve L-alanin ve L- antikapsinden oluşan bir dipeptid antibiyotiktir. Bu çalışmada, basilisin biyosentezinden sorumlu olan dipeptid sentetaz enziminin substrat özgüllüğü araştırılmıştır. Enzim, B.subtilis PY79'dan yüksek basınçlı jel kromatografisi (Superdex 200 kolonu) ile kısmen saflaştırılmıştır. In vitro basilisin biyosentezi ince tabaka kromatografî (TLC) ve Staphylococcus aureus'un test organizması olarak kullanıldığı filtre-kağıdı agar difluzyonu ile doğrulanmıştır. Substrat özgüllüğünü belirlemek için in vitro enzimatik aktivite testindeki L-alanin ve L-antikapsin yerine başka substratlar kullanılmıştır. L-antikapsin yerine furfurilamin, norefedrin, glisin ve benzilamin; L-alanin yerine ise sistein, glisin, aminoetilfosfonik asit ve l-(2- fiıril)-2,2,2 trifloro etanamin denenmiştir. Trifloro etanamin l-(2-furil)-2,2,2 trifluoro etanondan kimyasal olarak sentezlenmiştir. Furan ve trifloroasetik anhidrid trifluoro etanonun sentezi için başlangıç maddeleri olarak kullanılmışlardır. HCI.NH2OH ilavesi ile trifloro etanon okzimler sentezlenmiş, okzimlerin indirgenmesiyle de trifloro etanamin elde edilmiştir.Yeni ürün oluşumuna ince tabaka kromatografisi ile bakılmış ve pozitif TLC sonuçlu deneylerde dipeptid sentezinin doğrulanması için reaksiyon karışımı ekstraktlan gaz kromatografisi-kütle spektrometrisİ (GC-MS) analizine tabii tutulmuştur. Enzimin L- alanini furfurilamine, antikapsini de l-(2-füriI)-2,2,2 trifluoro ethanamine bağladığı gösterilmiştir. Anahtar kelimeler: Biyoaktif peptidler, Bacillus subtilis, dipeptidler, basilisin, enzimatik sentez. vı