Visualizing the protein-protein interactions network in virtual reality and mixed reality environments

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Modelleme ve Simülasyon Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2021

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: BÜŞRA ŞENDERİN

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Elif Sürer

Eş Danışman: Nurcan Tunçbağ

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Protein-protein etkileşimleri (PPE), iki veya daha fazla protein yapısının fiziksel bağlantı yapısını tanımlar. Bu etkileşimler birleştirildiğinde, protein-protein etkileşim ağı (PPEA) oluşur. Protein yapıları arasındaki bu etkiler belirgin etkileşimlerdir. Bu etkileşimler, proteinler üzerindeki belirli bağlanma yerlerinde meydana gelirler ve üstlendikleri belirli bir biyolojik fonksiyon bulunmaktadır. Bu ağlarla, sağlıklı veya hastalıklı bir hücre veya canlı organizma içindeki süreçler incelenebilir. Bu tezde, Sanal Gerçeklik (SG) ve Karma Gerçeklik (KG) ortamlarında PPEleri ve PPEAleri gözlemlemek için üç boyutlu bir görselleştirme sistemi geliştirilecektir. SG ve KG ortamları için sistemin ayrıntılı performans testleri sağlanacaktır ve analiz edilecektir.