Differential activation of immune cells by commensal versus pathogen-derived DNA

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2015

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: SİNEM GÜNALP

Danışman: MAYDA GÜRSEL

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bağışıklık sistemine katkıda bulunan kommensal ve patojen bakterilerden elde edilen ayırt edici sinyaller aktif bir çalışma alanıdır ve son bulgular kommensal ve patojenlerin farklı yapılarda patojene bağlı moleküler motifler ifade edebildiğini göstermektedir. Patojene bağlı moleküler motiflerin önemli bir üyesi olan, kommensal ve patojenden elde edilen bakteriyel DNAlar, bağışıklık sistemini farklı olarak aktive edebilme özelliğine sahiptir. Bu hipotezi denemek için 2 hakiki insan kommensal bakteri suşu olan Lactobacillus fermentum, Lactobacillus salivarus, bir kommensal suş Enterococcus faecium, bir virulent klinik izolat Enterococcus faecium ve 2 mutlak patojen; Listeria monocytogenes ve Streptococcus pyogenes suşlarının DNA'ları kullanılmıştır. İnsan periferik mononükleer kan hücreleri, insan monositleri, insan nötrofilleri, fare dalağı, THP-1 monositleri, endosomal DNA sensörü TLR9'u ve sitoplazmik DNA sensörleri ve STING adaptörünü stabil olarak ifade eden farklı hücre hattları insan kommensal ve patojen bakterilerinden elde edilen DNAların farklı dozlarıyla serbest halde veya lipofectamine 2000 ile kompleks edilmiş halde birlikte stimüle edilmiştir. Sonuçlar göstermektedir ki kommensalden elde edilen bakteriyel DNA'lar insan periferik kan hücrelerinde, tip-I interferon ağırlıklı bir immün yanıt göstermektedir. Buna karşın, STING adaptörüne sahip, IFN salınımını detekte eden B16 melanoma hücre hattında ve L929 mürin fibroblast hücre hattında bu fark gözlenilmemiştir, bu cevabın yaklaşık %30-60'ı STING adaptörüne bağlıdır. Patojenlerden elde edilen DNAlar, insan periferik kan hücrelerinden, insan nötrofillerinden ve fare dalak hücrelerinden büyük oranda TNFα, IL-6 ve/ya da IL-1β üretimini tetiklemiştir. Bununla uyumlu olarak, HEK hücrelerindeki patojen kaynaklı NF-κB aktivasyonu daha yüksek orandadır. Bulgularımıza göre; kommensal ve patojen kaynaklı bakteri DNAlarının farklı yapısal özellikleri, hücreye giriş yolları ve plazma nükleazlarına karşı olan dayanıklıkları, bağışıklık sistemi hücreleri tarafından farklı cevap verilmesine sebep olabilmektedir.