Selecting 2-FY RNA aptamers against SARS-CoV-2 particle
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, MOLEKÜLER BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2021
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: MERİÇ ÖZTÜRK
Danışman: AYŞE GÜL GÖZEN
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Yeni koronavirüs hastalığı (COVID-19) SARS-CoV-2 virüsünün insanlar ya da diğer hayvanlar tarafından enfekte olunması sonucu oluşur ve ateş, öksürük, soluma zorlukları, kas ağrısı ve ishal gibi klinik semptomlara sebep olur. İleri seviyedeki semptomlar hayati tehlike oluşturabilecek akciğer yangısı, dolaşım sistemi ve nadir de olsa nörolojik sorunlar olabilir. Çalışmalara göre tahmin edilen ölüm oranı % 4; kayıt altına alınmış vakalar göz önüne alındığında ise ölüm oranı % 2,3'tür. İleri seviyedeki ölümcül semptomların oluşmasını engellemek için hastalığın erken teşhisi son derece önemlidir. PCR testleri yaygın şekilde kullanılsa da bunların başarı oranı %60 civarındandır ve sonuçların elde edilmesi saatlerce veya günlerce sürebilmektedir. Dolayısıyla, daha daha etkili ve hızlı teşhis için kullanılacak yöntemlere ihtiyaç duyulmaktadır. Aptamerler, in vitro seçilip, hedef moleküllerine yüksek afinite ve özgüllükle bağlanabilen küçük nükleik asit molekülleridir. Tek zincirli DNA veya RNA yapıda olabildikleri gibi, sekanslarına özgün üç boyutlu yapılar kazanabilmektedirler. Aptamerler yapısal kararlılıklarını arttırmak için, afinitelerinde herhangi bir kayıp olmaksızın modifiye edilebilirler. Bu özellikler aptamerleri terapi ve teşhis amaçlı uygulamalar için kullanılabilir kılmaktadır. Bu çalışmada, SARS-CoV-2 parçacıklarına bağlanacak ve ileride optimize edilip COVID-19 hastalığının teşhisinde kullanılabilecek aptamerleri başarıyla elde ettik.