9-bp deletion, alu insertion and microsatellite polymorphisms in Anatolia and Central Asian Turks
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2001
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: SERAL İÇENER
Danışman: İNCİ ZEHRA TOGAN
Özet:oz ANADOLU'DA VE ORTA ASYA TÜRKLERİNDE 9-BÇ KAYBI (DELETION), ALU ARA-İLAVE (INSERTION) VE MİKROSATELİT POLİMORFİZİMLERİ İçener, Seral Yüksek Lisans, Biyolojik Bilimler Bölümü Tez Yöneticis: Prof. Dr. İnci Togan Eylül, 2001, 87 sayfa Bu çalışma mitokondriyal DNA (mtDNA) Sitokrom Oksidaz II/tRNALİ2İn (SOII/tRNALİZ ) 9-baz çifti (bç) kaybının (deletion), B65 Alu elementinin ve D1S1656 lokusunun Anadolu'dan, Kazakistan'dan ve Asya altpopulasyon bireylerinden (AAB), sırası ile 104, 18 ve 15 bireyden oluşan populasyonlarındaki sonuçlarım vermektedir. 9-bç kaybı Anadolulu bir bireyde ve Kazakistanlı dört bireyde gözlenmiştir.Türkmenistanlı bir bireyde ise SOII/tRNALlz bölgesinde bir ara-ilave (insertion) olduğu tespit edilmiştir. Anadolulu bireyin mtDNA kontrol bölgesininsekans analizi yaptırılmış ve J haplogrubuna ait olduğu tespit edilmiştir. Bu da daha önce görülen 9-bç kayıplarından bağımsız bir kökeni olabileceğini göstermektedir. B65 Alu elementinin sıklığı Anadolu, Kazakistan ve AAB oluşan populasyonlarında, sırasıyla 0.4612, 0.4167 ve 0.1667 olarak hesaplanmıştır. Üç populasyon da Hardy- Weinberg (H-W) dengesinde bulunmuştur (p>0.05). Anadolu populasyonu ve Anadolu'ya coğrafik olarak yakın olan komşu populasyonlar arasında ikili Fst genetik uzaklıkları hesaplanmıştır. Dİ S 1656 lokusunun allel ve genotip sıklıkları her üç toplum için de hesaplanmıştır. AAB populasyonu hariç, diğer iki toplumda H-W dengesinden bir sapma gözlenmemiştir (p>0.05). Ayrıca adli tıpta önemli olan bazı istatistiksel parametreler (Heterozigotluk ve Farklılaşma Kabiliyeti (Power of discrimination)) hesaplanmıştır. D1S1656 lokusunun oldukça yüksek farklılaşma kabiliyetine sahip olduğu ve kriminolojide kullanılabilecek önemli bir DNA işareti olabileceği anlaşılmıştır. Her üç toplumda da B65 ve Dİ S 1656 lokusu için birleştirilmiş farklılaşma kabiliyeti hesaplanmıştır ve her üç toplumda da yüksek değerler bulunmuştur (Anadolu toplumunda; 0.991, Kazaklarda; 0.999 ve AAB'de; 0.997). Bu da, bu iki DNA işaretinin kriminoljide, bu toplumlar için, birlikte kullanılabileceğini göstermektedir. B65 ve D1S1656 lokuslarının ortak allel uzaklığına dayalı ilişki ağacı, komşu-birleştirme (neighbour-joining) metoduyla çizilmiştir. Toplumlar arasında özel bir gruplaşma gözlenmemiştir. Anahtar kelimeler: Polimorfizm, 9-bç kaybı, B65 Alu elementi, Dİ S 1656, Anadolu, Kazakistan, Asya Altpopulasyonları, Farklılaşma Kabiliyeti, Fst, Ortak Allel Uzaklığı. vı