Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: DİLARA ÖĞÜTCÜ
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Çağdaş Devrim Son
Eş Danışman: Orkun Cevheroğlu
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:G proteine kenetli reseptörler (GPKR'ler), zara bağlı reseptörlerde en büyük ailedir ve çeşitli hücresel tepkileri düzenler. GPKR'lerin canlı hücrelerde homo- ve/veya hetero-oligomerik kompleksler oluşturduğu bilinmektedir. Bu kompleksler reseptörün olgunlaşmasını, trafiğini ve sinyalleşmeyi etkiler. Adhezyon G proteinine kenetli reseptörler (aGPKR'ler), memelilerde GPKR'lerin ikinci en büyük alt ailesidir. Doku ve organ gelişiminde rol oynayan hücre yüzeyindeki hücre dışı matriks proteinleri ve ligandlarla etkileşime girdikleri bilinmektedir. Bununla birlikte, aGPKR'lerin oligomerik yapı oluşturup oluşturmadığı tam olarak anlaşılamamıştır. Mevcut çalışmada, aGPKR'lerin bir üyesi olan ADGRE2/EMR2 ve bunun izoformlarından biri olan ADGRE2(125)/EMR2(125) reseptörleri, BRET ve FRET kullanılarak homo-oligomerizasyonu incelemek için floresan veya biyolüminesan proteinlerle işaretlendi. ADGRE2 çoğunlukla bağışıklık hücrelerinde eksprese edilir ve ekspresyonu, monosit/makrofaj farklılaşması sırasında yüksek oranda kontrol edilir. Ayrıca, ADGRE2, vibratuar ürtiker (titreşime bağlı kurdeşen) adı verilen otozomal dominant bir hastalık ile ilişkilidir. Hastalar mekanik uyaran nedeniyle ciltlerinde kızarıklık ve ödem yaşarlar. Bununla birlikte, bu reseptörün hücre içi işlevi tam olarak anlaşılamamıştır. Dimerizasyon ve oligomerizasyon, birçok GPKR'nin trafiği ve fonksiyonu için önemli olduğundan GPKR'lerin dimerize ya da oligomerize olup olmadığını anlamak, bilinmeyen fonksiyonlarını anlamamıza yardımcı olabilir. Bu çalışma, ADGRE2 ve ADGRE2(125) izoformlarının, plazma zarında farklı oligomerik durumda bulunma eğiliminde olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, hücre dışında bulunan bölgenin ADGRE2/EMR2 homo-oligomerizasyonu üzerinde bir etkisi olabilir. Bu bulgular, reseptör oligomerizasyonunun fizyoloji üzerindeki etkisini daha fazla araştırmamıza yardımcı olacaktır.