Fluorescent labeling of SPOCK1 and localization studies in live neural cell lines
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: ZEYNEP EDA KARABOĞA
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Çağdaş Devrim Son
Eş Danışman: Yeşim Aydin Son
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Alzheimer hastalığı demansın tedavi edilemeyen en yaygın şeklidir. Geç başlangıçlı Alzheimer hastalığı (LOAD) karmaşık genetik ile ilişkilidir ve moleküler arka planı henüz aydınlatılamamıştır. Genom çapında ilişkilendirme çalışmalarının (GWAS) meta-analizine ilişkin önceki araştırmamız, SPOCK1 varyantları ile LOAD arasında istatiksel bir korelasyonu ortaya koydu. Ayrıca klinik olarak LOAD ile bağlantılı proteinlerden biri olan apolipoprotein (APP) ile birlikte regülasyonu mevcuttur. Aynı zamanda SPOCK1 proteini, çeşitli kanserlerde hücre yapışmasındaki rolü nedeniyle son zamanlarda dikkat çekici bir konu haline gelmiştir. SPOCK1 ile ilgili mevcut literatür göz önüne alındığında SPOCK1'ın nöral hücrelerde Alzheimer patogenezini etkiyebileceğini düşünmekteyiz.Bu çalışmada, SPOCK1'in hücre ekspresyonunu ve lokalizasyonunu incelemek için floresan işaretlemeli SPOCK1'i insan nöroblastoma ve astroglia hücreleri kullanılarak çalışmalar yapıldı. Çeşitli organel işaretlemeleri ile IHC ve konfokal görüntü analizi yapıldı. İşaretli SPOCK1 proteinleri, işaretlenmemiş/normal proteinlerle ekspresyon ve hücre içi yerleşimleri açısından karşılaştırılmıştır. Çeşitli organel belirteçleri ile iki ayrı hücre hattında konfokal görüntülemeler gerçekleştirildikten sonra SPOCK1'in mitokondride lokalize olduğu bulunmuştur. SPOCK1'in in vitro lokalizasyonu ile ilgili bu çalışmada elde edilen veriler, gelecekte Alzheimer hastalığının moleküler altyapısının araştırılmasına katkı sağlayabilir.