Effects of nutrient depletion on translational regulation in HCT-116 colorectal cancer cells

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyokimya Anabilim Dalı, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: NAZLI ŞEVVAL MENEMENLİ

Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Sreeparna Banerjee

Eş Danışman: İREM EREL GÖKTEPE

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Tümör mikroçevresindeki kısıtlı besin kaynağı, hayatta kalmayı sağlamak için çok sayıda stres tepkisine bağlı yolakları aktive edebilir. Araştırmamız, HCT-116 hücrelerinin 24 saat boyunca düşük glikoz, glutamin ve serum içeren, besin açısından kısıtlı bir ortama maruz bırakılmasıyla, beklenildiği üzere mTOR yolağının inhibasyonuna yol açtığını göstermiştir. Ancak, mTOR yolağının bilinen bir hedefi ve bileşeni olan Ribozomal protein S6'nın (RPS6)'nın aktivasyonu da gözlemlenmiştir. mTOR yolağının inaktif olduğu durumlarda, bir MEK inhibitörü olan U0126'nın RPS6 fosforilasyonunu azaltması sonucuyla RPS6'nın MAPK yolu yoluyla fosforile edildiği gözlemlenmiştir. Kolorektal tümörlerden elde edilen ters faz protein dizisi (RPPA) veri analizi, RPS6 fosforilasyonunun ERK1/2 fosforilasyonu ile pozitif korelasyon içinde olduğunu göstermiştir. Ek olarak, polizom profili verileri, MAPK'nin U0126 ile inhibisyonunun, RPS6'nın aktivitesinin yanı sıra translasyonel düzenlemede katkısı olduğunu göstermiştir. Genel olarak bulgularımız, kısıtlı besiyerine bağlı olarak, HCT-116 kolorektal kanser hücrelerinde bir hayatta kalma mekanizması olarak RPS6 ve MAPK yolaklarının eşzamanlı aktivasyonuna yol açabileceğini göstermektedir.