Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyokimya Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2021
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: SEYDA TUĞÇE BALKAN
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Çağdaş Devrim Son
Eş Danışman: Fatma Küçük Baloğlu
Özet:
Hücre zarını yedi defa geçen hücre zarı protein ailesi GPKR’ler, hücre
dışı sinyalleri hücre içindeki ikincil haberci yoluna heterotrimerik G
proteinleri ile iletirler. Heterotrimerik G proteinleri α ve β-γ altbirimlerinden
oluşur. Geleneksel olarak bir GPKR’nin bir heterotrimerik G protein ile
etkileştiği düşünülüyordu, ancak son yıllardaki çalışmalar GPKR
oligomerizasyonunu göstermektedir. GPKR oligomerizasyonu, hücrelerin sinyal
iletimi dengesini ve gereken cevabı vermesini sağlamaktadır. Navarro ve arkadaşlarının
ve Ferré ve arkadaşlarının A1 ve A2A reseptör heterotetramerleri ve A2A ve D2
reseptör heterotetramerleri ile yaptıkları çalışmalar bu yapılarda teorik
olarak G protein α altbirimlerinin etkileşim yakınlığında bulunduğunu
göstermektedir. Bu teorik etkileşim, daha önce, FRET gibi ileri florasan
mikroskopi teknikleri kullanılarak valide edilmemiştir. FRET tekniği donör
florofor ve akseptör florofor ile işaretlenen proteinlerin, donör ve akseptör
proteinler arasında gerçekleşen enerji transferi vasıtası ile fiziksel
protein-protein etkileşimlerinin incelenmesine izin vermektedir. Bu tez
çalışmasında, Gαi ve Gαs etkileşimleri FRET tekniği ile araştırılmıştır. Ek
olarak agonist varlığında, CGS (CGS-21680) ve Quinpirole kullanılarak A2A ve D2
reseptör heterotetramer etkisi araştırılmıştır. G protein ailesi üyesi ve G
protein α altbirimi ile yüksek yapısal homolojisi olan K-Ras proteininin reseptör bağımsız
homodimerizasyon çalışmalarına dayanılarak (Dempke & Heinemann, 2009), Gα
proteinlerinin reseptör etkileşimlerinin fiziksel etkileşimlerine olan etkisi, Gα
spesifik minigenler kullanılarak araştırılmıştır.