Activation of survival pathways in nutrient restricted colorectal cancer cells
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2023
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: GÖKSU ORAL
Danışman: Sreeparna Banerjee
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Tümör mikro-çevresindeki kısıtlı besin varlığı, kanser hücrelerinin hayatta kalmak için otofaji gibi yolakların aktivasyonu ile metabolik olarak kendilerini yeniden düzenlemesine neden olmaktadır. Çalışmamız LoVo hücrelerinin düşük konsantrasyonda glikoz, glutamin ve serum içeren besiyeri ile 48 saat inkübasyonunun, düşük enerjiye bağlı olarak fosforile olan ve katabolizmanın aktivasyonundan sorumlu AMP Kinaz yolağı ile anabolik sinyal yolaklarına bağımlı olarak protein sentezinden ve hücre büyümesinden sorumlu Ribozomal protein S6'nın eşzamanlı aktivasyonu ile sonuçlandığını göstermiştir. AMPK yolağının aktivasyonu, beklenildiği gibi, besin kısıtlı hücrelerde düşük enerji üretimine bağlı olarak otofajinin tetiklenmesiyle açıklanabilir. Beklenilenin aksine kısıtlı besin varlığına maruz kalan hücrelerde RPS6'nın fosforilasyonu ise, mTORC1 yolağının kısmi aktivasyonuna ve aktif MAPK yolaklarına bağlanmıştır. MAPK yolağının aktivasyonunun hücre canlılığı üzerine pozitif etkisi, besin kısıtlı hücrelerin MAPK inhibitörü ile tedavisi sonrasında hücre ölümünde dikkate değer bir artış ile gözlemlenmiştir. Hem RPS6 hem de AMPK yolağının aktivasyonuna sahip kolorektal tümörlerin halka açık ters faz protein dizisi (RPPA) verilerinin analizi, onkojenik büyüme ve transkripsiyon faktörlerinin zenginleştiğini ortaya çıkarmıştır, ki bu da aksi halde oldukça farklı olan bu yolakların birlikte aktivasyonunun hayatta kalma mekanizması olarak kullanıldığını düşündürmektedir. Genel olarak, verilerimiz, kısıtlı besin ortamının, kolorektal kanser hücrelerinde hayatta kalma mekanizması olarak AMPK ve RPS6'nın birlikte aktivasyonuna yol açabileceğini göstermektedir.