Phage therapy against contamination of pathogenic Escherichia coli strains (O104:H4, O157:H7, and O26) during garden cress (Lepidium sativum Linn.) vegetation
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoteknoloji Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: İREM İSKENDER
Danışman: YEŞİM SOYER KÜÇÜKŞENEL
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Gıda kaynaklı patojenlerin kontamine ettiği taze tüketilen gıdaların sebebiyet verdiği salgınlar dünya çapında artış göstermektedir. Bu tip salgınlara, en çok yol açan patojenlerden biri Escherichia coli'dir. Gıda kaynaklı patojenlerin taze tüketilen gıdalara bulaşmasının en temel yollarından biri sulama suyudur ve bulaştıktan sonra elimine edilmesi daha zordur. Eliminasyon sırasında en yaygın olarak kullanılan dezenfektanlar klor bazlı kimyasal maddelerdir. Ancak, bu tip maddelerin kullanımı insan sağlığı için giderek kimyasal risk teşkil etmektedir. Bu nedenle, gıda kaynaklı patojenlerden korununabilmek için sahada uygulanabilecek yeni bir yöntem araştırılmalıdır. Bu çalışma, taze tüketilen bahçe terelerinin vejetasyonu sırasında sulama suyu ile patojenik E. coli suşları (O104:H4, O157:H7 ve O26) için alternatif bir korunma yöntemi araştırmayı amaçlamıştır. İlk olarak, tereler sulama suyu ile bu suşlarla 105 CFU/mL ve/veya 108 CFU/mL bakteri yükleriyle kontamine edildi. E. coli kontaminasyonu ve faj uygulama günleri farklı olan altı grup oluşturuldu. Sonrasında, planlanan sulama takvimine göre her bir suşa karşı enfeksiyon çokluğu (MOI) = -1 veya 100 olan tekli ve kokteyl faj uygulaması yapıldı. 30. günde yapraklar toplanarak toplam ve biyofilm oluşturan E. coli sayımı yapıldı ve kontrol grupları ile karşılaştırıldı. Ayrıca, Taramalı Elektron Mikroskobu ile yaprak yüzeyindeki E. coli tutunması gözlemlendi. E. coli O104:H4'e karşı iki farklı MOI değerine sahip tekli ve kokteyl olmak üzere üç farklı faj uygulaması yapıldı. E. coli O104:H4'e karşı MOI = 100 olan tekli faj uygulaması toplam ve biyofilm oluşturan E. coli sayısında sırasıyla 0,47 log ve 0,33 log azalma görüldü. E. coli O104:H4'e karşı MOI = -1 olan tekli faj uygulaması, toplam ve biyofilm oluşturan E. coli sayısında sırasıyla 2,60 log ve 2,45 log azalmaya yol açtı. E. coli O104:H4'e karşı MOI = 100 olan koktely faj uygulaması, toplam ve biyofilm oluşturan E. coli sayılarında sırasıyla 1,06 log ve 0,93 log azalmaya neden oldu. E. coli O157:H7'ye karşı MOI = 100 olan kokteyl faj uygulandığında, toplam E. coli'de 1,94 log azalma ve biyofilm oluşturan E. coli'de 2,35 log azalma gözlendi. E. coli O26'ya karşı MOI = 100 olan tekli faj uygulaması yapıldı ve toplam ve biyofilm oluşturan E. coli sayıları sırasıyla 1,83 log ve 1,90 log azladı. Buna göre, bu çalışmanın sonuçları, patojenik E. coli suşlarına karşı faj uygulamasının, sahada taze tüketilen yeşil yapraklılar üzerinde sulama sırasında biyokontrol ajanı olarak umut verici bir uygulama olabileceğini göstermektedir. Faj uygulaması ile vejetasyon sırasında E. coli kontaminasyonunu tamamen elimine etmek için çalışmalar sürdürülmelidir.