Design of a microfluidic platform for real-time enumeration and retrieval of low concentration of cells
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyomedikal Mühendisliği Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: BUKET ŞAHİN
Danışman: HALUK KÜLAH
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Nadir hücrelerin geri kazanımı için geliştirilen cihazların karakterizasyonu için spiking deneyleri önemlidir. Ancak, seri seyreltme gibi varyasyonun oldukça yüksek olduğu geleneksel yöntemlerle standart bir laboratuvar ortamında çok düşük konsantrasyonlarda tümör hücreleri toplamak zordur. Tek hücre toplamaya yönelik diğer platformlar son derece yüksek maliyetlidir ve standart laboratuvarlarda mevcut değildir. Çok düşük sayıda hücreyi (1-100) herhangi bir numune kaybı ve ölü hacim olmadan yüksek doğrulukla toplamak için düşük maliyetli, tekrarlanabilir ve sağlam bir mikroakışkan platform öneriyoruz. Platform, bir PDMS mikroakışkan çip ve çıkış rezervuarına bağlı, sıfır ölü hacim sağlayan esnek bir hidrolik rezervuar (FHR) içerir. Sistemi karakterize etmek için, floresanla boyanmış hücreler kanaldan geçirilmiş ve doğrudan FHR'ye bağlı pipet ucunda toplanmıştır. Mikro kanaldan geçen hücreler mikroskop altında izlenmiş ve gerçek zamanlı olarak sayılmıştır. Ardından, toplanan hücreler bir kuyu plakasına ekilmiş ve karşılaştırma için sayılmıştır. Toplanan ortalama hücre sayısı hedeflenen 10, 50 ve 100 MCF7 hücresi için sırasıyla 9,2±2,4- 49,4±5,9 ve 98,5±6,2 olarak bulunmuştur. Sayım doğruluğu, gerçek zamanlı ve toplanan hücre sayıları arasındaki doğrusal regresyon (R2=0,9964) ile gösterilmiştir. Mikroakışkan platform hücre canlılığını etkilememektedir. Önerilen sistem, nadir hücre izolasyon platformlarının analitik performans karakterizasyonu veya az sayıda hücre gerektiren diğer analitik çalışmalarda düşük sayıda hücrenin doğru şekilde sayılması için düşük maliyetli ve sağlam bir teknik sunmaktadır.