DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION OF PNCES A4 IN POPULUS NIGRA


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: RAITHA AKKAD

Danışman: Zeki Kaya

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Populus nigra L., nehir kıyısı ekosistemlerinde en kritik öncü ağaç türü olmaya borçludur ve ekolojik ve ekonomik olarak zorunlu hızlı büyüyen türler olarak kabul edilir. Ayrıca, biyokütle ve biyoenerji kullanımı ve "selüloz içeriği" özelliğinin manipülasyonu için harika bir ağaç türüdür. Fosil yakıtlardan elde edilen sınırlı enerji kaynakları, Populus nigra'nın büyük bir aday olduğunu gösterdiği alternatif verimli biyokütle mahsulleri gerektirir. Bu çalışmada, Populus nigra L'de selüloz ile ilgili CESA (selüloz sentaz) ikincil hücre duvarı ile ilgili "PnCesA4" alt birim gen ifadesi araştırıldı. CESA alt birimlerini içeren selüloz sentaz kompleksi (CSC), "CesA4/ 7 ve 8" ikincil hücre duvarı regülasyonu ve tutulumu için henüz tam olarak keşfedilmemiştir. Böylece, CESA ikincil hücre duvarı ile ilgili alt birim genlerinden Populus nigra'da tek kopya selülaz sentaz geni olan PnCesA4 alt birim geninin ifade edimesi araştırıldı. PnCesA4 gen ifadesine ek olarak, Taşkıran (2020) tarafından sağlanan veriler kullanılarak bu genin UGPase ve SuSy aktivitesi, büyüme ve selüloz karakterleriyle olan ilişkileride etraflıca araştırıldı. Çalışmanın sonuçları şaşırtıcı bir şekilde beklenenin aksine PnCesA4 gen ifade seviyeleri ile büyüme özellikleri (boy ve Çap) arasında negatif korelasyonlar bulundu. Ayrıca ilginç bir şekilde PnCesA4 gen ifadesi, selüloz içeriği veya selüloz sentezleyen enzimler ile ilişkili olmadığı görüldü. Buluan bu sonuçlar birlikte değerlendirildiğinde, bu genin bulunduğu biyokimyasal yolakda daha karmaşık bir düzenleme ve CesA4 alt birimi için henüz bilinmeyen daha benzersiz bir işlevi olduğu düşünülmektedir.