CACO-2 KOLON KANSERİ HÜCRELERİNDE BESİN AÇLIĞI VE LİZOZOMAL ALKALİZASYON İLE KISMİ EMT İNDÜKSİYONU
Tez Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Tez Danışmanı: Prof. Dr. Sreeparna Banerjee
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: İngilizce
Özet:
Kısıtlı besin mevcudiyetine maruz kalan kanser hücrelerinde, hayatta kalmak için otofaji gibi süreçlerin aktivasyonu ile kendini gösteren metabolik yeniden yapılandırmalar gerçekleşmektedir. Çalışmamız ilk kez, 48 saat boyunca kısıtlı glikoz, glutamin ve serumdan oluşan bir besin açlığı (NR) ortamında inkübe edilen Caco-2 hücrelerinin hayatta kaldığını ancak daha az proliferatif olduğunu, güçlü otofaji indüksiyonu ile birlikte 5-Fluorourasil'e karşı daha dirençli olduğunu göstermektedir. Bununla birlikte, besin açlığında kargo proteini p62 seviyesinin beklenildiği şekilde azalmadığı ve otofajik akışta yavaşlama olduğunu gösterdik. Ayrıca Bafilomycin A1 (Baf) ile lizozomal asiditenin bozulması, NR hücrelerinde gen ekspresyonu ve hücresel morfolojideki değişikliklerle kısmi epitelyalden mezenkimal geçiş (EMT) aktivasyonu gerçekleştiğini ortaya çıkardı. Bu gözlemlerden farklı olarak, konflüensiye bağlı kendiliğinden farklılaşan Caco-2 hücreleri, otofaji indüksiyonu, fonksiyonel otofajik akış ve daha fazla epitelyal özellik gösterdi. Caco-2 hücrelerinin 3D sferoid kültürü, NR muamelesi sonucunda sıkı olmayan sferoidlerin oluştuğunu, Baf ilavesinin hücre adezyon kaybıyla birlikte sferoid oluşumunun tamamen kaybına yol açtığını ortaya çıkardı. Erken evre ve geç evre vii otofaji inhibitörleri ile elde ettiğimiz veriler, otofaji indüksiyonunun kendisinden ziyade, belki de p62 birikimi yoluyla daha yavaş otofajik akışın, NR Caco-2 hücrelerinde kısmi EMT ve daha düşük ilaç duyarlılığı gelişiminde rol oynayabileceğini göstermektedir. Genel olarak, verilerimiz, düşük besin mevcudiyetinin, özellikle lizozomlar daha az asidik ise, kısmi EMT programının aktivasyonuna yol açabileceğini göstermektedir.