Isoprenoid pathway metabolite analyses in S. cerevisiae via LCMS and HPLC


Uzman Dr. TAMAY ŞEKER

Tez Türü: Post Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Technical University of Denmark, Center for process biotechnology, Danimarka

Tez Danışmanı: Prof. Dr. Jens Nielsen

Tezin Onay Tarihi: 2004

Tezin Dili: İngilizce

Desteklendiği Program: Diğer

Özet:

Mevalonat iz yolu, izoprenoidlerin sentezi için gerekli ara maddelerin üretiminde önemli rol oynar ve asetil CoA ile başlayıp, terpenoid ve sterollerin sentezlendiği üretim noktası farnesil pirofosfata kadar giden 20 den fazla biyokimyasal reaksiyon içerir. Membran esnekliğinde rol oynayan steroller, hormonlar, karotenoidler, antioksidanlar, ubikinonlar ve protein glikozlanmasında rol alan dolikoller vb bir çok farklı tipte izoprenoid bulunmaktadır. İzoprenoidler  aroma maddesi olarak kullanımdan (limonene), koku maddelerine (geraniol, citranellol, vb.) ve kanser önleyici maddelere kadar uzanan geniş bir ticari ilgi alanı içinde yer alır. Bir çok biyoaktif madde bu iz yolundan sentezlendiği için iz yolunun kontrolü ve sentezlerin yönlendirilmesi metabolizma mühendisliği açısından ilgi çekici bir alandır. Buradan hareketle, gıda katkı maddeleri ve farmakolojik maddelerin üretimine ek olarak  büyük ölçekli üretim için de uygun bir organizma olması nedeniyle maya, bu tip maddelerin endüstriyel üretimi için oldukça uygundur. In vivo akıların kontrolünde rol oynayan temel kavramları öğrenmek için,  izyolu ürünlerinin etkin yöntemlerle analizi gereklidir. Bu izyolu maddelerinin S. cerevisiae' da ki seviyelerine ilişkin bir yaklaşım elde etmek için bir analiz metodu geliştirildi ve izoprenoid izyolunun ilk üç metaboliti, S. cerevisiae' nın glikoz ve galaktoz üzerinde ki kesikli büyümesi boyunca ve üç farklı seyrelme hızında gerçekleştirilen glikoz kısıtlı kemostatta durağan faz boyunca ölçüldü.