HNRNPA1’İN MİRNA REGÜLASYONUNDAKİ ROLÜ


Arş. Gör. Dr. İBRAHİM ÖZGÜL

Tez Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye

Tez Danışmanı: Ayşe Elif Erson Bensan

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: İngilizce

Özet:

Heterojen nükleer ribonükleoprotein A1 (HNRNPA1) RNA biyolojisi ile ilişkilendirilmiş çok fonksiyonlu bir RNA-bağlayıcı proteindir. HNRNPA1’in rapor edilen birkaç miRNA’ya doğrudan bağlandığı düşünüldüğünde, HNRNPA1’in doğrudan ya da dolaylı olarak diğer mıRNA’ları regüle edebileceği hipotezini kurduk. Bundan dolayı, yüksek çıktılı bir sistem kullanarak, RNAi yöntemiyle silinen HNRNPA1’nin miRNA seviyelerini etkileyip etkilemeyeceğini test etmeyi planladık. MDA-MB-231 hücrelerini ve stabil HNRNPA1 susturmasını model olarak kullanıp değişmiş miRNA seviyelerini belirleyeceğiz ve deneysel teyidini sağlayacağız. Etkilenen miRNA’ların ve hedef genlerinin ağ ve yolak analizi hücresel mekanizmalar üzerindeki etkiyi anlamamıza yardımcı olacaktır.