Prof. Dr. RENGÜL ATALAY


Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı


WoS Araştırma Alanları: Klinik Tıp, Klinik Tıp (Med), Yaşam Bilimleri (Life), Biyoloji Ve Biyokimya, Farmakoloji Ve Toksikoloji, Moleküler Biyoloji Ve Genetik, Onkoloji, Matematiksel Ve Hesaplamalı Biyoloji, Farmakoloji Ve Eczacılık, Hücre Biyolojisi, Biyokimya Ve Moleküler Biyoloji


Avesis Araştırma Alanları: Sağlık Bilimleri, Eczacılık, Temel Eczacılık Bilimleri, Temel Bilimler, Yaşam Bilimleri, Biyoinformatik, Biyoenformasyon, Biyolojik Modelleme, Biyolojik Veritabanları, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Genetik Bozuklukların Moleküler Biyolojisi, Genomiks, Kanser Moleküler Biyolojisi, Protein Mühendisliği

Araştırmacı kurumdan ayrılmıştır

E-posta: rengul@metu.edu.tr
İş Telefonu: +90 312 210 7887
Web: https://avesis.metu.edu.tr/rengul
Ofis: B227
Posta Adresi: Enformatik Enstitüsu

Metrikler

Yayın

76

Yayın (WoS)

31

Yayın (Scopus)

19

Atıf (WoS)

283

H-İndeks (WoS)

7

Atıf (Scopus)

261

H-İndeks (Scopus)

6

Atıf (Scholar)

1

H-İndeks (Scholar)

1

Proje

14

Tez Danışmanlığı

11

Açık Erişim

9
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Eğitim Bilgileri

1994 - 1997

1994 - 1997

Doktora

Université Paris-Sud: Paris XI, Biologie Moleculaire Et Biochimie, Fransa

1993 - 1994

1993 - 1994

Yüksek Lisans

Université Paris-Sud: Paris XI, Systemes-Biologiques-İntegres, Fransa

1985 - 1992

1985 - 1992

Lisans

Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıp Pr., Türkiye

Araştırma Alanları

Sağlık Bilimleri

Eczacılık

Temel Eczacılık Bilimleri

Temel Bilimler

Yaşam Bilimleri

Biyoinformatik

Biyoenformasyon

Biyolojik Modelleme

Biyolojik Veritabanları

Moleküler Biyoloji ve Genetik

Genetik Bozuklukların Moleküler Biyolojisi

Genomiks

Kanser Moleküler Biyolojisi

Protein Mühendisliği

Yönetilen Tezler

Makaleler

Tümü (18)
SCI-E, SSCI, AHCI (17)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (17)
Scopus (17)
Diğer Yayınlar (1)

Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler

2019

2019

2. A NEW THIADIAZINE DERIVATIVE INDUCES OXIDATIVE STRESS DEPENDENT CELL DEATH IN HEPATOCELLULAR CARCINOMA STEM CELLS

KAHRAMAN D. C., GÜVEN E. B., Aytac P., TOZKOPARAN KÖPRÜCÜ B., ATALAY R.

Annual Meeting of the American-Association-for-the-Study-of-Liver-Diseases (AASLD) / Liver Meeting, Massachusetts, Amerika Birleşik Devletleri, 8 - 12 Kasım 2019, cilt.70, (Özet Bildiri) identifier

2019

2019

3. iBioProVis: Interactive Visualization and Analysis of Compound Bioactivity Space

Dönmez A., RİFAİOĞLU A. S., ACAR A. C., DOĞAN T., Martin M. J., ATALAY R., et al.

27th Conference on Intellient Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology, Basel, İsviçre, 21 - 25 Temmuz 2019, (Özet Bildiri)

2019

2019

4. A new thiadiazine derivative induces oxidative stress dependent JNK pathway activation and cell death in hepatocellular carcinoma

KAHRAMAN D. C., GÜVEN E. B., TOZKOPARAN KÖPRÜCÜ B., ATALAY R.

Annual Meeting of the American-Association-for-Cancer-Research (AACR), Georgia, Amerika Birleşik Devletleri, 29 Mart - 03 Nisan 2019, cilt.79, (Özet Bildiri) identifier

2018

2018

5. Drug-Target Interaction Prediction with Deep Convolutional Neural Networks Using Compound Images

RİFAİOĞLU A. S., ATALAY M. V., Martin M. J., ATALAY R., Doğan T.

26th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Chicago, Amerika Birleşik Devletleri, 6 - 10 Temmuz 2018, (Özet Bildiri)

2018

2018

6. Automated Negative Gene Ontology Based Functional Predictions for Proteins with UniGOPred

Doğan T., RİFAİOĞLU A. S., Saidi R., Martin M. J., ATALAY M. V., ATALAY R.

26th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Chicago, Amerika Birleşik Devletleri, 6 - 10 Temmuz 2018, (Özet Bildiri)

2018

2018

9. Differential alteration of IL-8 in liver cancer stem cell enrichment in response to PI3K/Akt/mTOR inhibitors and sorafenib

Kahraman D. C., Kahraman T., ATALAY R.

American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018, Chicago, Amerika Birleşik Devletleri, 12 - 18 Nisan 2018, cilt.78, ss.3937, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

2017

2017

12. Classification of Hematoxylin and Eosin Images Using Local Binary Patterns and 1-D SIFT Algorithm†

OGUZ O., ÇETİN A. E., ATALAY R.

International Workshop on Computational Intelligence for Multimedia Understanding (IWCIM), KOS, Yunanistan, 02 Eylül 2017, cilt.2, ss.94-97, (Tam Metin Bildiri)

2017

2017

16. Synthesis and In Vitro Anticancer Activity of Novel 6,8,9-Trisubstituted Purine Analogs

POLAT M. F., TUNÇBİLEK M., DURMAZ İ., ATALAY R.

3 rd International Multidisciplinary Symposium on Drug Research and Development - DRD 2017, Erzurum, Türkiye, 5 - 07 Ekim 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

18. Gene mutations involved in drug resistance in liver cancer cells using a new rna-seq data analysis workflow

Guzelcan E. A., Shojaei M., ACAR A. F., ATALAY R.

42nd European-Society-for-Medical-Oncology Congress (ESMO), Madrid, İspanya, 8 - 12 Eylül 2017, cilt.28, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

2017

2017

19. Prediction of Enzymatic Properties of Protein Sequences Based on the EC Nomenclature

DALKIRAN A., Doğan T., RİFAİOĞLU A. S., ATALAY M. V., Martin M. J., ATALAY R.

ISMB/ECCB 2017: 25th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Prag, Çek Cumhuriyeti, 21 - 25 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

20. Investigation of Multi-task Deep Neural Networks in Automated Protein Function Prediction

RİFAİOĞLU A. S., Martin M. J., ATALAY R., ATALAY M. V., Doğan T.

ISMB/ECCB 2017: 25th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology, Prag, Çek Cumhuriyeti, 21 - 25 Temmuz 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

21. Investigation of Multitask Deep Neural Networks for Protein Function Prediction

RİFAİOĞLU A. S., Martin M. J., ATALAY R., ATALAY M. V., Doğan T.

10th The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT 2017), Erdemli, Kıbrıs (Kktc), 28 - 30 Haziran 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

22. Prediction of Enzymatic Properties of Protein Sequences Based on the EC Nomenclature

DALKIRAN A., RİFAİOĞLU A. S., Doğan T., ATALAY M. V., Martin M. J., ATALAY R.

10th The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT 2017), Kalkanlı, Kıbrıs (Kktc), 28 - 30 Haziran 2017, ss.37, (Özet Bildiri)

2017

2017

23. Identification of Gene Mutations Involved in Drug Resistance in Liver Cancer Using Rna-Seq Data Analysis

Shojeai M., Akhan E., ACAR A. C., ATALAY R.

The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, (HIBIT), 28 - 30 Haziran 2017, (Özet Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

2017

2017

26. Cancer Drug Discovery: Targeting PI3K/AKT/mTOR Cell Survival Pathway

ATALAY R.

European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) - Shared Facilities, Cambridge, Kanada, 13 Haziran 2017, (Tam Metin Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

2017

2017

27. ECPred: An Automated Enzymatic Function Prediction Tool Based on Combination of Different Classifiers

DALKIRAN A., RİFAİOĞLU A. S., Doğan T., ATALAY M. V., Martin M. J., ATALAY R.

GLBIO 2017: Great Lakes Bioinformatics Conference, May 15-17, Şikago, Amerika Birleşik Devletleri, 15 - 17 Mayıs 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

28. EClerize: A Customized Force-Directed Layout Algorithm for Biological Networks with EC Attributes

Danacı H. F., ATALAY R., ATALAY M. V.

GLBIO 2017: Great Lakes Bioinformatics Conference, Şikago, Amerika Birleşik Devletleri, 15 - 17 Mayıs 2017, (Özet Bildiri)

2017

2017

29. UniGOPred: A Large Scale Automated GO Term Annotation System for UniProtKB

RİFAİOĞLU A. S., Doğan T., SARAÇ Ö. S., Saidi R., ATALAY M. V., Martin M. J., et al.

GLBIO 2017: Great Lakes Bioinformatics Conference, Şikago, Amerika Birleşik Devletleri, 15 - 17 Mayıs 2017, (Özet Bildiri)

2016

2016

30. Dielectrophoretic Spectra of CD133+/EpCAM+ HUH7 Cancer Stem Cells and HUH7 Cancer Cells

Çağlayan Z., Demircan Yalçın Y., Özkayar G., Kahraman D. C., Atalay R., Özgür E., et al.

Dielectrophoresis 2016, Massachusetts, Amerika Birleşik Devletleri, 13 - 15 Temmuz 2016, ss.1-4, (Tam Metin Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma

2016

2016

33. Mixture of Learners for Cancer Stem Cell Detection Using CD13 and H&E Stained Images

OĞUZ O., Akbas C. E., Mallah M., TAŞDEMİR K., Guzelcan E. A., Muenzenmayer C., et al.

Conference on Medical Imaging - Digital Pathology, California, Amerika Birleşik Devletleri, 2 - 03 Mart 2016, cilt.9791, (Tam Metin Bildiri) Creative Commons License Sürdürülebilir Kalkınma identifier identifier

2015

2015

34. DETECTION OF CANCER STEM CELLS IN MICROSCOPIC IMAGES BY USING REGION COVARIANCE AND CODIFFERENCE METHOD

Oguz O., Muenzenmayer C., Wittenberg T., ÜNER A., ÇETİN A. E., Atalay R. C.

International Workshop on Computational Intelligence for Multimedia Understanding (IWCIM), PRAGUE, Çek Cumhuriyeti, 29 - 30 Ekim 2015, (Tam Metin Bildiri) Sürdürülebilir Kalkınma identifier

2015

2015

35. MULTI-RESOLUTION SUPER-PIXELS AND THEIR APPLICATIONS ON FLUORESCENT MESENCHYMAL STEM CELLS IMAGES USING 1-D SIFT MERGING

Yorulmaz O., Oguz O., Akhan E., TUNCEL D., ATALAY R., ÇETİN A. E.

IEEE International Conference on Image Processing (ICIP), Quebec City, Kanada, 27 - 30 Eylül 2015, ss.2495-2499, (Tam Metin Bildiri) identifier

2015

2015

36. Computational drug target prediction and validation in PI3K AKT pathway

Dogan T., Ersahin T., Rifaioglu A., Diago P., Nightingale A., Martin M. J., et al.

ISMB/ECCB 2015 Dublin, Dublin, İrlanda, 10 - 14 Temmuz 2015, (Özet Bildiri)

2015

2015

38. Synergistic antitumor activity of sorafenib and Akt Inhibitors

Tulin E., Durmaz I., ATALAY R.

EACR-AACR-SIC 2015, 20 - 23 Haziran 2015, (Özet Bildiri)

2015

2015

40. Wavelet Merged Multi-resolution Super-pixels and Their Applications on Fluorescent MSC Images

Yorulmaz O., Oguz O., Akhan E., TUNCEL D., ATALAY R., ÇETİN A. E.

23nd Signal Processing and Communications Applications Conference (SIU), Malatya, Türkiye, 16 - 19 Mayıs 2015, ss.1901-1904, (Tam Metin Bildiri) identifier

2012

2012

42. Genetic variants within endotoxin signaling pathway association with asthma and atopy phenotypes

ŞAHİNER Ü. M., YAVUZ S., Buyuktiryaki B., BİRBEN E., Topaloglu E., TUNCER A., et al.

31st Congress of the European-Academy-of-Allergy-and-Clinical-Immunology (EAACI), Geneva, İsviçre, 16 - 20 Haziran 2012, cilt.67, ss.469, (Özet Bildiri) identifier

2012

2012

43. Association of asthma with polymorphisms in the endotoxin signaling pathway

ŞAHİNER Ü. M., YAVUZ S., Buyuktiryaki B., BİRBEN E., Topaloglu E., TUNCER A., et al.

31st Congress of the European-Academy-of-Allergy-and-Clinical-Immunology (EAACI), Geneva, İsviçre, 16 - 20 Haziran 2012, cilt.67, ss.469-470, (Özet Bildiri) identifier

2012

2012

44. Single nucleotide polymorphisms in the endotoxin signaling pathway and their relationship with in vitro IgE synthesis

ŞAHİNER Ü. M., YAVUZ S., Buyuktiryaki B., BİRBEN E., Topaloglu E., Yaman A., et al.

31st Congress of the European-Academy-of-Allergy-and-Clinical-Immunology (EAACI), Geneva, İsviçre, 16 - 20 Haziran 2012, cilt.67, ss.467-468, (Özet Bildiri) identifier

2011

2011

45. Genetic variants within the endotoxin signaling pathway and their effects on in-vitro IgE synthesis

ŞAHİNER Ü. M., YAVUZ S., Buyuktiryaki B., BİRBEN E., Topaloglu E., Yaman A., et al.

30th Congress of the European-Academy-of-Allergy-and-Clinical-Immunology (EAACI), İstanbul, Türkiye, 11 - 15 Haziran 2011, cilt.66, ss.115, (Özet Bildiri) identifier

2011

2011

46. Genetic variants within the endotoxin signaling pathway and asthma: an association study

ŞAHİNER Ü. M., YAVUZ S., Buyuktiryaki B., BİRBEN E., Topaloglu E., TUNCER A., et al.

30th Congress of the European-Academy-of-Allergy-and-Clinical-Immunology (EAACI), İstanbul, Türkiye, 11 - 15 Haziran 2011, cilt.66, ss.60, (Özet Bildiri) identifier

2004

2004

47. Prediction of protein subcellular localization based on primary sequence data

Ozarar M., Atalay V., Atalay R.

IEEE 12th Signal Processing and Communications Applications Conference, Kusadasi, Türkiye, 28 - 30 Nisan 2004, ss.118-120, (Tam Metin Bildiri) identifier identifier

Kitaplar

2019

2019

1. Chapter 5 - Cardiac Glycosides and Oxidative Stress in Liver Cancer

ATALAY R., Durmaz i.

The Liver, Vinood B. Patel, Editör, Academic Press , Londrina, ss.55-61, 2019

2015

2015

2. Molecular Biology of Liver Cancer

Tulin E., ÖZTÜRK M., ATALAY R.

Reviews in Cell Biology and Molecular Medicine, Robert A. Meyers, Editör, John Wiley and Sons, Inc., ss.206-243, 2015

Desteklenen Projeler

2015 - 2019

2015 - 2019

Protein Kinaz İnhibitörlerinin Hücre Sinyal Yollarındaki Yeni Hedeflerinin Sistem Biyolojisi Yöntemleri İle Tanımlanması

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

ATALAY R. (Yürütücü)

2017 - 2017

2017 - 2017

Protein İşlevlerinin Altdizi Analizi ile Büyük Ölçekte Öngörme Yöntemleri

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Diğer

ATALAY M. V. (Yürütücü), ATALAY R., DALKIRAN A., RİFAİOĞLU A. S.


Atıflar

Toplam Atıf Sayısı (WOS): 285

h-indeksi (WOS): 7