Biyomineralizasyon Sürecinde Kullanılacak Sıralı Enzimatik Tepkimeler İçin Programlanabilir Sentetik Gen Devresi Tasarımı

TÜBİTAK - AB COST Projesi , 2015 - 2018

Proje Türü: TÜBİTAK - AB COST Projesi
Başlama Tarihi: Temmuz 2015
Bitiş Tarihi: Temmuz 2018

Proje Özeti

Silika ve silikon tabanlı malzemeler pekçok teknolojik uygulamada sıklıkla kullanılmaktadırlar. Pekçok farklı litografi yöntemleri kullanılarak içerisinde Si ve bileşiklerinin yer aldığı mikroçipler ve nano ve mikro yapılar üretilmektedirler. Si ve bileşikleri sadece elektronik endüstrisinin kullandığı malzemeler değildir, şaşırtıcı bir şekilde bir çok farklı deniz canlısının ve bakterinin de silikon ve bileşiklerini yapılarında barındırdıkları bilinmektedir. Diatomlar başta olmak üzere bazı deniz canlıların da ise silikon tabanlı malzemelerin bu canlıların yapısal bütünlüğü açısından elzem olduğu bilinmektedir. Bu gözlemden yola çıkarak bu organizmalarda silikon ve bileşikleri tabanlı malzemelerin oluşma tepkimelerini katalizleyen proteinlerin ve biyolojik moleküllerin bulunduğu ortaya konmuştur. Bu bilgiler ışığında bu çalışma kapsamında Si ve bileşiklerini içeren malzemelerin üretimleri/ modifikasyonları sırasında kullanılmak üzere, hali hazırda varolan kimyasal sistemlerin yerini alabilecek hücresel bir sistem tasarımı yapılması amaçlanmaktadır. Bu amaçla tek bir enzimden oluşan bir sistem yerine daha işlevesel sentetik gen devresi tasarımı ortaya konacaktır. Çalışmanın sonucunda, silika malzemelerin üretimini/modifikasyonlarını/aşındırılmasını, mikro-nano fabrikasyon amacı için sağlayacak enzimleri bir sinyal yolağı altında üretebilen bir hücre sistemi - sentetik biyoloji yöntemleri ile oluşturulmuş ? ortaya konacaktir. Bu sayede çevreye dost, ucuz bir biyo-nanofabrikasyon süreci ortaya konulacaktır.