Çalık P. (Yürütücü)
TÜBİTAK Projesi, 2015 - 2018
İnsan
büyüme hormonu (hGH), 22 kDa molekül
ağırlığında, 191 amino asitten oluşan, beynin ön lobundaki hipofiz bezi
tarafından üretilen bir proteindir. Hipofiz bezlerindeki somatotropik hücreler
tarafından doğal olarak sentezlenen, kanda bulunan hGH’nin, insan
organizmasında eksik, bozuk (defective) üretiminin neden olduğu problemlerin
düzeltilmesi için dışarıdan verilme ihtiyacı –diğer hormonlar gibi- bu farmasötik temel maddenin biyoteknolojik
prosesle endüstriyel üretimini önemli yapmaktadır. Bu proje kapsamında, gliseraldehit-3-fosfat
dehidrojenaz başlatıcısının (promotör) (PGAP)
üzerinde bulunan transkripsiyon faktörlerinin bağlanma bölgelerini
transkripsiyon mühendisliği ile modifiye ederek rekombinant protein (r-protein)
üretimini artırmak hedeflenmiştir. Pichia
pastoris’te en çok kullanılan başlatıcılardan biri olan PGAP, olası transkripsiyon
faktörlerinin (TF) bağlanma bölgeleri açısından analiz edilmiştir. Bulunan TF
bağlanma bölgeleri silinerek ya da doğal konumlarında duplike edilerek PGAP varyant kütüphanesi
oluşturulmuştur. Aynı zamanda, seçilen TF’ler aşırı-ekspres edilerek ya da
silinerek, bu faktörlerin r-protein üretimine etkisi araştırılmıştır.
Geliştirilen PGAP
varyantları altında modifiye yeşil floresan proteini üretiminin ekspresyon
seviyeleri, doğal PGAP’a
kıyasla 0.35-3.10 kat arasında değişim göstermiştir. En yüksek ekspresyon
seviyelerine ulaşan başlatıcı varyantları olan Pro9 (Gal4-benzeri TF bağlanma
bölgesinin duplike edildiği) ve Pro10 (Rfx1 bağlanma bölgesinin silindiği)
kontrolü altında ikinci model protein, rekombinant insan büyüme hormonu (rhGH),
ekspres edilmiş; doğal PGAP’a
kıyasla, sırasıyla, 2.4 ila 1.6 kat daha fazla rhGH üretilmiştir. Yarı-kesikli
biyoreaktör işletim koşullarında, Pro9 kontrolü altında ve Gal4-benzeri TF’nin aşırı-ekspres edildiği
suş ile rhGH üretiminde birim hücre başına 2.2 kat artış elde edilmiştir.
Geliştirilen hibrit yarı-kesikli işletim ile en yüksek rhGH derişimi t = 8 st’te, CrhGH = 611 mg dm-3 elde
edilmiştir.