MARMOD FAZ II Projesi, birinci aşamada geliştirilen tek boyutlu modeli, yeni veri ve gözlemlerle birlikte üç boyutlu bir modele dönüştürmeyi, kara kökenli besin yüklerinde kademeli olarak azaltım hedefleri belirleyerek Marmara Denizi'nde iyi kalite deniz ekosisteminin tekrar gelişimine olanak sağlamayı ve gerçeğe yakın simüle eden "Dijital İkiz"i oluşturmayı hedeflemiştir. Bu kapsamda, ODTÜ Deniz Bilimleri Enstitüsü’nün yürütücülüğünde ve T.C. Çevre, Şehircilik ve İklim Bakanlığı ÇED İzin ve Denetim Genel Müdürlüğü tarafından desteklenen proje, 13 Aralık 2023 tarihinde ODTÜ-Kültür Kongre Merkezi'nde gerçekleştirilen Kapanış Çalıştayı ile sona ermiştir. Bakanlık uzmanları, Türkiye Çevre Ajansı heyeti, ODTÜ Deniz Bilimleri Enstitüsü araştırmacıları ve ulusal araştırma kurumlarından katılımcılar çalıştayda bir araya gelerek Marmara Denizi'nin mevcut durumu ve Dijital İkiz çalışmaları üzerine değerlendirmelerde bulunmuşlardır. Çalıştayda, MARMOD FAZ II Projesi'nin sonuçları, yük azaltım önerileri ve Marmara Denizi'nin oksijen seviyesinin iyileştirilmesi için besin elementleri yüklerinin azaltılmasına yönelik eylem planı tartışılmıştır. Marmara Denizi'nin ekolojik denge sorunlarına çözüm bulabilmek adına projenin elde ettiği veriler, sorumlu kurumlar, bölgesel paydaşlar ve araştırmacılarla paylaşılmıştır.