Metrikler
Yayın
40
Açık Erişim
4
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
Eğitim Bilgileri
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam EdiyorPost Doktora
Technische Universitaet München, Münih Teknik Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Clinic and Polyclinic for Surgery, Almanya
2017 - 2023
2017 - 2023Doktora
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı, Türkiye
2014 - 2016
2014 - 2016Yüksek Lisans
Sabancı Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü, Türkiye
2010 - 2013
2010 - 2013Lisans
İstanbul Üniversitesi, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü, Türkiye
Yaptığı Tezler
2023
2023Doktora
IDENTIFICATION OF NOVEL DRUG BINDING SEQUENCE PATTERNS IN PI3K/AKT/MTOR SIGNAL PATHWAY PROTEINS INVOLVED IN LIVER CANCER
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü
2016
2016Yüksek Lisans
Development of spion-based theranostic nanocarriers for small rna delivery and cancer gene therapy 
Sabancı Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü
Yabancı Diller
C1 İleri
C1 İleriİngilizce
Araştırma Alanları
Biyoenformasyon
Biyolojik Modelleme
Moleküler Biyoloji ve Genetik
Kanser Moleküler Biyolojisi
Sağlık Bilimleri
Akademik Ünvanlar / Görevler
2019 - Devam Ediyor
2019 - Devam EdiyorAraştırma Görevlisi
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı
Makaleler
Tümü (7)
SCI-E, SSCI, AHCI (6)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (7)
ESCI (1)
Scopus (7)
2022
20221. Vicinal Diaryl-Substituted Isoxazole and Pyrazole Derivatives with in Vitro Growth Inhibitory and in Vivo Antitumor Activity
Turanll S., Nalbat E., Lengerli D., İbiş K., Güntekin Ergün S., Akhan Güzelcan E., et al.
ACS Omega
, cilt.7, sa.41, ss.36206-36226, 2022 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
20212. Data Centric Molecular Analysis and Evaluation of Hepatocellular Carcinoma Therapeutics Using Machine Intelligence-Based Tools
Cetin-Atalay R., Kahraman D. C., Nalbat E., Rifaioğlu A. S., Atakan A., Dönmez A., et al.
JOURNAL OF GASTROINTESTINAL CANCER
, cilt.52, sa.4, ss.1266-1276, 2021 (ESCI, Scopus)
2021
20213. Synthesis and biological evaluation of novel isoxazole-piperazine hybrids as potential anti-cancer agents with inhibitory effect on liver cancer stem cells
Ibis K., NALBAT E., ÇALIŞKAN B., KAHRAMAN D. C., Cetin-Atalay R., BANOĞLU E.
EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
, cilt.221, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2021
20214. CROssBAR: comprehensive resource of biomedical relations with knowledge graph representations.
DOĞAN T., Atas H., Joshi V., ATAKAN A., Rifaioglu A. S., NALBAT E., et al.
Nucleic acids research
, cilt.49, sa.16, 2021 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
20205. Treatment of breast cancer with autophagy inhibitory microRNAs carried by AGO2-conjugated nanoparticles.
Unal O., Akkoc Y., Kocak M., Nalbat E., Dogan-Ekici A., Yagci A., et al.
Journal of nanobiotechnology
, cilt.18, ss.65, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2020
20206. DEEPScreen: high performance drug-target interaction prediction with convolutional neural networks using 2-D structural compound representations
RİFAİOĞLU A. S., NALBAT E., Atalay V., Martin M. J., Cetin-Atalay R., DOĞAN T.
CHEMICAL SCIENCE
, cilt.11, sa.9, ss.2531-2557, 2020 (SCI-Expanded, Scopus)
2018
20187. Synthesis and cellular bioactivities of novel isoxazole derivatives incorporating an arylpiperazine moiety as anticancer agents.
ÇALIŞKAN B., Sinoplu E., Ibis K., Guzelcan E. A., Atalay R. C., BANOĞLU E.
Journal of enzyme inhibition and medicinal chemistry
, cilt.33, sa.1, ss.1352-1361, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
Hakemli Bilimsel Toplantılarda Yayımlanmış Bildiriler
2025
20251. Comprehensive In Silico Profiling of Dual-Specificity Phosphatases in Hepatocellular Carcinoma: Novel Biomarkers and Therapeutic Targets
Nalbat E.
X. Multidisciplinary Cancer Research Congress, Eskişehir, Türkiye, 8 - 11 Mayıs 2025, ss.60, (Tam Metin Bildiri)
2025
20252. Hepatosellüler karsinomda DUSP11’in İşlevsel Profili: Bağışıklık Kaçışı ve Klinik Heterojenliğe Etkisi
NALBAT E.
16. Ulusal Karaciğer Kongresi, Ankara, Türkiye, 15 - 18 Mayıs 2025, (Özet Bildiri)
2025
20253. Unveiling Molecular Biomarkers of MASLD Fibrosis: A Transcriptomic and Pathway Enrichment Analysis
NALBAT E., KAHRAMAN D. C.
AASLD-TASL Hepatology Connect Meeting 2025, İstanbul, Türkiye, 14 - 15 Şubat 2025, (Özet Bildiri)
2025
20254. Prognostic and therapeutic insights into LTBP1 in Hepatocellular Carcinoma: pathway enrichment, immune profiling, and drug repurposing
NALBAT E., Gülhan R. U.
AASLD-TASL Hepatology Connect Meeting, İstanbul, Türkiye, 14 Şubat 2025, (Özet Bildiri)
2024
20245. Deciphering Transcriptional Landscapes of Mild and Advanced MASLD Fibrosis: Insights into Differential Gene Expression, Pathway Enrichment, and Drug Repurposing Opportunities
NALBAT E., KAHRAMAN D. C.
17th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, İstanbul, Türkiye, 18 - 20 Aralık 2024, (Özet Bildiri)
2024
20246. In Silico Analysis of Latent Transforming Growth Factor β Binding Protein Family Expression Patterns and Prognostic Value in Hepatocellular Carcinoma
Gülhan R. U., Nalbat E.
17th The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, İstanbul, Türkiye, 18 Aralık 2024, ss.151, (Özet Bildiri)
2024
20247. CCL2 as a Key Mediator of Neural Invasion in Tumor Progression: An In Silico Study
Yıldırım B., Nalbat E.
17th The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, İstanbul, Türkiye, 18 Aralık 2024, ss.159, (Özet Bildiri)
2024
20248. Vicinal Diaryl-Substituted Compounds: Promising Therapeutics for Breast Cancer
NALBAT E., GÜNTEKİN ERGÜN S., TURANLI S., LENGERLİ D., ÇALIŞKAN B., BANOĞLU E., et al.
2024 Annual Congress of the European Association for Cancer Research (EACR 2024), Rotterdam, Hollanda, 10 - 13 Haziran 2024, (Özet Bildiri)
2024
20249. Hepatocellular Carcinoma: Evaluation of Vicinal Diaryl Isoxazole and Pyrazole Derivatives with Implications for Oxidative Stress and Senescence-mediated Anti-tumor Mechanisms
NALBAT E., AKHAN GÜZELCAN E., TURANLI S., LENGERLİ D., ÇALIŞKAN B., BANOĞLU E., et al.
EASL Liver Cancer Summit 2024, 22 - 24 Şubat 2024, (Özet Bildiri)
2024
202410. Exploring Cytotoxic Bioactivities of Newly Identified Compounds against Hepatocellular Carcinoma
Nalbat E., Akhan Güzelcan E., Turanlı S., Çalışkan B., Banoğlu E., Atalay R.
AASLD-TASL Hepatology Connect Meeting, İzmir, Türkiye, 16 - 17 Şubat 2024, ss.32-33, (Özet Bildiri)
2024
202411. Exploring early markers of fibrosis progression in metabolic dysfunction–associated steatotic liver disease in Turkiye
KAHRAMAN D. C., NALBAT E., ATALAY R., İDİLMAN R.
AASLD-TASL Connect Meeting 2024, İzmir, Türkiye, 16 - 17 Şubat 2024, (Özet Bildiri)
2023
202312. Repurposing Drugs to Target Molecular Networks in Hepatocellular Carcinoma Cells & Stem Cells for Innovative Treatment Strategies
NALBAT E., TUNÇBAĞ N., KAHRAMAN D. C., ATALAY R.
4th Open Research Day, Türkiye, 01 Aralık 2023, (Özet Bildiri)
2023
202313. Exploring novel vicinal diaryl-substituted isoxazole and pyrazole derivatives as cytotoxic compounds for targeting breast cancer: Mechanisms and therapeutic potential
NALBAT E., GÜNTEKİN ERGÜN S., TURANLI S., LENGERLİ D., ÇALIŞKAN B., BANOĞLU E., et al.
XVIII. Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, Ankara, Türkiye, 26 - 29 Ekim 2023, (Tam Metin Bildiri)
2023
202314. Breaking Barriers in Cancer Treatment: Unleashing the Power of Drug Repurposing
NALBAT E.
3rd International Multidisciplinary Cancer Research Congress, İstanbul, Türkiye, 7 - 09 Eylül 2023, (Özet Bildiri)
2023
202315. Network-based drug repurposing approach identifies novel drugs and drug combinations against HCC
NALBAT E., TUNÇBAĞ N., KAHRAMAN D. C., ATALAY R.
AASLD-TASL Digital Hepatology Meeting, Ankara, Türkiye, 28 - 29 Nisan 2023, (Özet Bildiri)
2022
202216. Network-based in silico modeling for drug repurposing and in vitro validation in hepatocellular carcinoma
Nalbat E., Tunçbağ N., Atalay R.
15th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), Mersin, Türkiye, 20 - 21 Ekim 2022, ss.1-2, (Özet Bildiri)
2022
202217. Bazı Visinal Diaril Heterosiklik Bileşiklerin Antikanser Aktivitelerinin Araştırılması
TURANLI S., NALBAT E., AKHAN GÜZELCAN E., ATALAY R., ÇALIŞKAN B., BANOĞLU E.
VI.Ulusal Farmasötik Kimya Kongresi, İstanbul, Türkiye, 26 - 29 Ağustos 2022, (Tam Metin Bildiri)
2022
202218. KARACİĞER KANSERİ KÖK HÜCRELERİ ÜZERİNDE İNHİBİTÖR ETKİYE SAHİP, POTANSİYEL ANTİKANSER AJANLAR OLARAK YENİ İZOKSAZOL-PİPERAZİN HİBRİTLERİNİN SENTEZİ VE BİYOLOJİK OLARAK DEĞERLENDİRİLMESİ
İBİŞ K., NALBAT E., ÇALIŞKAN B., ATALAY R., BANOĞLU E.
VI. Ulusal Farmasötik Kimya Kongresi, İstanbul, Türkiye, 26 - 29 Ağustos 2022, (Tam Metin Bildiri)
2022
202219. Synthesis and Biological Evaluation of Novel Isoxazole-Piperazine Hybrids as Potential Anticancer Agents with Inhibitory Effects on Liver Cancer Stem Cells
İbiş K., Nalbat E., Çalışkan B., Atalay R., Banoğlu E.
VI. Ulusal Farmasötik Kimya Kongresi, İstanbul, Türkiye, 26 - 29 Ağustos 2022, ss.58-61, (Özet Bildiri)
2022
202220. BAZI VİSİNAL DİARİL HETEROSİKLİK BİLEŞİKLERİN ANTİKANSER AKTİVİTELERİNİN ARAŞTIRILMASI
Turanlı S., Nalbat E., Akhan Güzelcan E., Atalay R., Çalışkan B., Banoğlu E.
VI. Ulusal Farmasötik Kimya Kongresi, İstanbul, Türkiye, 26 - 29 Ağustos 2022, ss.40-42, (Özet Bildiri)
2022
202221. Identification of undefined off-targets of novel drugs and drug combinations with network-based in silico modeling and in vitro validation in hepatocellular carcinoma
Nalbat E., Tunçbağ N., Atalay R.
EACR 2022 Annual Meeting, Sevilla, İspanya, 20 - 23 Haziran 2022, ss.3-4, (Özet Bildiri)
2022
202222. Anticancer activity of novel vicinal diaryl isoxazole compounds in hepatocellular carcinoma
Nalbat E., Akhan Güzelcan E., Turanlı S., Lengerli D., Çalışkan B., Banoğlu E., et al.
EASL Liver Cancer Summit 2022, 3 - 04 Şubat 2022, ss.137-138, (Özet Bildiri)
2022
202223. Novel isoxazole- piperazine derivatives inhibit the stemness of HCC cells
NALBAT E., İBİŞ K., ÇALIŞKAN B., BANOĞLU E., ATALAY M. V., ATALAY R.
AASLD-TASL Digital Hepatology Meeting, Ankara, Türkiye, 15 Ocak 2022, ss.5-6, (Tam Metin Bildiri)
2020
202024. In vitro validation of drug-target interactions revealed in silico by Comprehensive Resource of Biomedical Relations with Network Representations and Deep Learning (CROssBAR) in HCC
NALBAT E., RİFAİOĞLU A. S., DOĞAN T., Martin M. J., Cetin-Atalay R., ATALAY M. V.
AACR Annual Meeting, ELECTR NETWORK, 22 - 24 Haziran 2020, cilt.80, (Özet Bildiri)
2020
202025. Synthesis of New Vicinal Diaryl Five-Membered Heterocyclic Compounds with Potential Anticancer Activity
TURANLİ S., LENGERLİ D., ÇALIŞKAN B., AKHAN GÜZELCAN E., NALBAT E., ATALAY R., et al.
8th International Drug Chemistry Conference, 27 Şubat - 01 Mart 2020, (Özet Bildiri)
2019
201926. CROssBAR: Comprehensive Resource of Biomedical Relations with Network Representations and Deep Learning”, Oral presentation
Atalay M. V., Doğan T., Atalay R., Nalbat E., Rifaioğlu A. S., Ataş H., et al.
27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology, Basel, İsviçre, 21 - 25 Temmuz 2019, (Yayınlanmadı)
2019
201927. In silico modeling and in vitro validation of undefined off-target of drugs in hepatocellular carcinoma
Sinoplu E., Tuncbag N., Kahraman D. C., Atalay R. C.
Annual Meeting of the American-Association-for-Cancer-Research (AACR), Georgia, Amerika Birleşik Devletleri, 29 Mart - 03 Nisan 2019, cilt.79, (Özet Bildiri)
2019
201928. Abstract 996: In silico modeling and in vitro validation of undefined off-target of drugs in hepatocellular carcinoma
NALBAT E., TUNÇBAĞ N., KAHRAMAN D. C., ATALAY R.
AACR Annual Meeting 2019, Atlanta, Amerika Birleşik Devletleri, 29 Mart - 03 Nisan 2019, (Özet Bildiri)
2018
201829. SYNTHESIS, CYTOTOXICITY AND STRUCTURE-ACTIVITYRELATIONSHIPS OF NOVEL ISOXAZOLE DERIVATIVES ASANTICANCER AGENTS
İbiş K., ÇALIŞKAN B., AKHAN GÜZELCAN E., Sinoplu E., ATALAY R., BANOĞLU E.
RICT 2018, 4 - 06 Temmuz 2018, (Özet Bildiri)
2018
201830. SYNTHESIS AND ANTIPROLIFERATIVE EVALUATION OF NOVEL ISOXAZOLE-PIPERAZINE HYBRIDS
ÇALIŞKAN B., Sinoplu E., İbiş K., AKHAN GÜZELCAN E., ATALAY R., BANOĞLU E.
RICT 2018, 4 - 06 Temmuz 2018, (Özet Bildiri)
Kitaplar
2025
20251. DNA Nasıl Paketlenir?
NALBAT E., GÜNTEKİN ERGÜN S., YURTCU E.
EPİGENETİK, , Editör, PALME YAYINEVİ, Ankara, ss.11-22, 2025
Desteklenen Projeler
2021 - 2024
2021 - 2024Az Biyoaktif Bileşik Verisi Olan Proteinlere Karşı Sanal Tarama için Derin Öğrenme Modelleri (Azderin)
TÜBİTAK Projesi , 1001 - Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Projelerini Destekleme Programı
Atalay M. V. (Yürütücü), Kahraman D. C., Doğan T., Acar A. C., Atalay R., Nalbat E.
2021 - 2024
2021 - 2024Yeni Kinazolinon Türevi Çözünür Epoksit Hidrolaz (sEH) İnhibitörlerinin Geliştirilmesi-Öncelikli Alan Araştırma Projesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Araştırma Projesi
Nalbat E.
2021 - 2024
2021 - 2024
Izoksazol türevli antikanser özellikli bileşiklerin karaciğer kanseri kök hücreleri üzerindeki etki mekanizmasının incelenmesi
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje , BAP Doktora
ATALAY M. V. (Yürütücü), NALBAT E.
2017 - 2020
2017 - 2020Derin Öğrenme Teknikleri Ve Ağ Analizi Yöntemleriyle Hazırlanmış Kapsamlı Biyomedikal İlişkiler Kaynağı
TÜBİTAK Uluslararası İkili İşbirliği Projesi , 2551 - British Council ile İkili İşbirliği Programı
ATALAY M. V. (Yürütücü)
Patent
2023
2023AMRİNONE İLE BRİGATİNİB İLAÇ KOMBİNASYONUNUN KARACİĞER KANSERİNDE KULLANIMI
Patent
Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: 2021 020093 , Standart Tescil
2023
2023SİNYAL AĞI ANALİZLERİ İLE KARACİĞER KANSERİNE KARŞI İLAÇ KOMBİNASYONLARININ TESPİTİ
Patent
Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: 2021 020090 , Standart Tescil
2022
2022BRİGATİNİB İLE SUNİTİNİB İLAÇ KOMBİNASYONUNUN KARACİĞER KANSERİNDE KULLANIMI
Patent
Tescil Edildi, Buluşun Tescil No: 2021 020102 , Standart Tescil
Bilimsel Kuruluşlardaki Üyelikler / Görevler
2023 - Devam Ediyor
2023 - Devam EdiyorTürk Biyokimya Derneği
Üye
2023 - Devam Ediyor
2023 - Devam EdiyorTıbbı Biyoloji ve Genetik Derneği
Üye
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorEuropean Association for Cancer Research
Üye
2022 - Devam Ediyor
2022 - Devam EdiyorMoleküler Kanser Araştırma Derneği (MOKAD)
Üye
2021 - Devam Ediyor
2021 - Devam EdiyorTürk Karaciğer Araştırmaları Derneği
Üye
2021 - Devam Ediyor
2021 - Devam EdiyorAvrupa Karaciğer Araştırmaları Derneği
Üye
2017 - Devam Ediyor
2017 - Devam EdiyorAmerican Association for Cancer Research (AACR)
Üye
2014 - Devam Ediyor
2014 - Devam EdiyorHÜCRE ÖLÜMÜ ARAŞTIRMA DERNEĞİ
Üye
Ödüller
Aralık 2024
Aralık 20245th Open Research Day - Special Mention
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü
Aralık 2024
Aralık 20245th Open Research Day AWARDS - Special Mention
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü
Nisan 2023
Nisan 2023PATENTLETÜRKİYE Üniversiteler Arası Patent Yarışması
Türk Patent Ve Marka Kurumu
Ocak 2022
Ocak 20222022 FAALİYET YILI AKADEMİK PERFORMANS DEĞERLENDİRME ÖDÜLÜ
Orta Doğu Teknik Üniversitesi
Haziran 2020
Haziran 2020
American Association for Cancer Research (AACR) Global-Scholar-In-Training Awards (GSITA) program
American Association For Cancer Research
Burslar
2017 - 2019
2017 - 2019100/2000 YÖK Doktora Bursu
YÖK
Atıflar
Toplam Atıf Sayısı (WOS): 282
h-indeksi (WOS): 5
Bilimsel Araştırma / Çalışma Grubu Üyelikleri
2025 - Devam Ediyor
2025 - Devam Ediyor