Ros1, RAG1, RAG3' and IGF2 RFLP analysis of some hotchery rainbow trout (oncorhynchus mykiss) populations in Turkey


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2001

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: CEREN CANER BERKMAN

Danışman: İNCİ ZEHRA TOGAN

Özet:

öz TÜRKİYE'DE BULUNAN BAĞZI GÖKKUŞAĞI ALABALIĞI (Oncorhynchus mykiss) ÇİFTLİKLERİNDE Ras1, RAG1, RAG3' VE IGF2 GEN BÖLGELERİ İLE RFLP ÇALIŞMASI CANER BERKMAN, CEREN Yüksek Lisans, Biyoloji Bölümü Tez Yöneticisi : Prof. Dr. inci TOGAN Eylül 2001, 88 sayfa Gökkuşağı alabalığının (Oncorhynchus mykiss) genetik yapısı hakkında birçok çalışma mevcut olmasına rağmen nükleer DNA restiriksiyon parçacık uzunluğu polimorfizmine dayanan çok az sayıda çalışma bulunmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye'deki dört alabalık çiftliğinden altı populasyonun, genetik yapıları RFLP tekniği kullanılarak dört nükleer gen bölgesi (Ras1, RAG1, RAG3' and İGF2) için incelenmiştir. Çalışma sonucunda çalışılan populasyonlar için toplam onsekiz haplotip belirlenmiştir. Bunlardan beş tanesi sadece belirli populasyonlarda bulunan özel haplotiplerdir. Elde edilen frekansarın yeterince yüksek olmaması nedeniyle bu haplotiplerin populasyonlar arasında ayırtaç olarak kullanılabileceği düşünülmemektedir.Çalışmada elde edilen haplotiplerin dört faklı bölge oluşturduğu görülmüştür. Amerika'dan ithal edilen populasyonda genellikle dördüncü bölgedeki haplotipler gözlemlenmiştir. Türkiye'de üretimi daha uzun zamandır yapılan ve karıştırılmış populasyonlarda ise 1-3 bölgeler ya da tüm haplotip bölgeleri gözlemlenmiştir. Çalışılan gen bölgelerine göre Türkiye'de bulunan ve yurt dışından gelen populasyonların heterozigotluk düzeylerinin birbirine yakın olduğu belirlenmiştir. Populasyonlar içindeki haplotip farklılaşmasının nükleotid farklılaşmasından biraz daha fazla olduğu gözlenmiştir ve bu da populasyonların ortak bir orijini olduğunu göstermektedir. Buna rağmen çizilen "majority rule consensus tree" ile bölgeler arası farklılık gözlemlenebilmektedir. Örnekleme sırasında yapılan anketler bir populasyonda düşük büyüme hızı olduğunu belirlemiştir. Ancak bu populasyon genetik yapısı bakımından diğer populasyonlardan belirgin bir fark göstermemiştir. Büyüme hızındaki bu farklılığın bu çiftlikteki düşük su sıcaklığı sebebiyle ortaya çıkmış olabileceği düşünülmektedir. Anahtar kelimeler : Ras1, RAG1, RAG3', IGF2, restiriksiyon parçacık uzunluğu polimorfizmi, gökkuşağı alabalığı, Oncorhynchus mykis, çiftlik populasyonları, nükleer genler. VI