Biyolojik ağların interaktif görselleştirilmesi için crossbar web servisinin implementasyonu


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2020

Öğrenci: Ahmet Atakan

Danışman: MEHMET VOLKAN ATALAY

Özet:

Deneysel biyomedikal ara¸stırmalara yardımcı olmak için mevcut i¸slemsel araçlar ve hizmetlerin, veri çe¸sitliligi ve veri ba ˘ glantılılı ˘ gı açılarından eksiklikleri bulundu ˘ gun- ˘ dan dolayı, gerçek problemlere çözüm üretme noktasında sınırlı kalmaktadır. Çe¸sitli biyomedikal kaynaklarla birlikte yapay ve derin ögrenmeye dayalı yöntemlerle ge- ˘ li¸stirilen kapsamlı bir hesaplama kaynagına dayalı tahminler, ilaç ke¸sfi problemi için ˘ olu¸sturulan CROssBAR projesi kapsamındaki CROssBAR veritabanına (CROssBARVT) entegre edilmi¸stir. Kullanılar açısından CROssBAR-VT’de kolayca arama yapmak ve ardından arama sonuçlarının görsellenmesi büyük önem arz etmektedir. Bundan dolayı CROssBAR ag servisinin tasarımı, geli¸stirilmesi ve gerçekle¸stirilmesi bu ˘ tez kapsamında yapılmı¸stır. CROssBAR ag servisinde olu¸sturulan bilgi grafları, açık ˘ kaynak kodlu çizge kütüphanesi olan Cytoscape.js kullanırak üretilmi¸stir. CROssBAR ag servisine crossbar.kansil.org ba ˘ glantısı üzerinden ula¸sılabilir.