Genetic identity of Anatolian Sheepherd Dog (ASD) population using microsatellites
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2001
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: EVREN KOBAN
Danışman: İNCİ ZEHRA TOGAN
Özet:öz ANADOLU ÇOBAN KÖPEĞİ POPÜLAS YÖNÜNÜN' GENETİK ÖZGÜNLÜĞÜNÜN MÎKROSATELİTLERLE ARAŞTIRILMASI KOB AN, Evren Yüksek Lisans, Biyoloji Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. İnci TOGAN Eylül 2001, 109 sayfa Anadolu Çoban Köpeği (AÇK) güçlü yapısı, sadakati ve zor koşullara olan dayanıklılığı sebebiyle, Anadolu'da sürülere bekçilik etmesi için en çok tercih edilen köpek olmuştur. Bu özellikleri onu, Amerika'da, Avustralya'da, bazı Avrupa ve Afrika ülkelerinde de en iyi sürü bekçilerinden biri yapmaktadır. AÇK adı altında toplanan başlıca 3 tip köpek vardır; Kangal, Akbaş ve Kars köpeği. Fakat, Uluslararası Sinoloji Federasyonu (Federation Cynologique Internationale) tarafından yayınlanan tür standartları bu üç grubun sergilediği farklılıkları dikkate almamaktadır. Bu çalışmada, AÇK'nın (n=29, 24 Kangal ve 5 Akbaş) orta Anadolu sokak köpeklerinden (n=51) genetik farklılıklarını bulmak amacıyla 100 mikrosatelit lokusu incelenmiştir. vıAğız içi yanak mukozasından alman doku örneklerinden elde edilen DNA üzerindeki seçilen lokuslar florasan işaretli primerler kullanılarak, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) metoduyla yükseltgenmiş ve PCR ürünleri % 6Tık poliakrilamid jellere yüklenerek ABI 377 yan-otomatik DNA analizöründe koşturulmuştur. Veriler GenescanT ve GenotyperT programlan kullanılarak toplanmıştır. Verilerin istatiksel analizi için Genetex 4.0 programından yararlanılmıştır. Populasyon içi genetik çeşitlilik, averaj heterozigotluk ve ortalama alel sayılan ile ölçülmüştür. Populasyonlar alellerin frekansı ve dağılımı açısından farklılık göstermiştir. Populasyon içi ve populasyonlar arası yapıyı ve bireyler arası varyasyonu gözlemlemek için Wright'in F parametreleri, Faktöryel Eleman Analizi (Factorial Component Analysis) yapılmış. Ayrıca Da genetik uzaklığı ile alel paylaşım uzaklığı matriksleri kullanılarak komşu birleştirme (Neighbor-joining) metodu ile çizilen filogenetik ağaçlar kullanılmıştr. Sokak köpeklerinde 330, Kangal ve Akbaş'ta ise sırasıyla 51 ve 5 populasyona özgü alel gözlenmiştir. Gözlemlenen bu yüksek alel sayısı, köpeklerdeki erken evciltme merkezlerinden birinin bu bölgede yada bölgeye yakın bir yerde bulunduğuna işaret etmekte olabilir. vııBireylerin mevcut verilere göre yapılan simülasyonlar sonucu hangi populasyonlara ait olabilecekleri analiz edildiğinde en yüksek alel sayısına sahip 10 lokusun yeterli bilgiyi sağladığı görülmüştür. Bu çalışmanın sonuçlan AÇK'nın çalışılan sokak köpeği popülasyonundan farklı olduğu ve ayrıca AÇK olarak adlandırılan Kangal ve Akbaş popülasyonlarının da birbirinden önemli derecede farklılaştıklarım (Fst=0-094, P<0.00) göstermektedir. Kangal popülasyonunun genetik uzaklık açısından sokak köpeklerine yada bu köpeklerin bölgesel gen havuzuna daha yakın olduğu tesbit edilmiştir. Anahtar kelimeler: Anadolu çoban köpeği, sokak köpeği, köpek, mikrosatelit, genetik farklılık vııı