A preliminary study on genetic differentation among Turkish brown trout (Salmo trutta L.) populations as revecaled by RFLP analysis of PCR amplified mitochondrial DNA segments


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 1999

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: FÜSUN GEZGİN

Danışman: İNCİ ZEHRA TOGAN

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu çalışmada, Türkiye'nin 3 ayrı bölgesinden toplana kahverengi alabalık (Salmo trutta L.) toplumlarının genetik yapısı, mitokondriyal DNA m iki böldesi açısından araştırılmıştır. Mitokondriyal DNA mn iki bölgesi: ND-1 ve ND-5/6 polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltıldı ve bu genlerin kesim parçacıkları uzunluk polimorfizmi (RFLP) analizi yapıldı.ND-1 geni 7 restriksiyon enzimi ile kesildi. Tek bir haplotip gözlendi. Bu haplotip çalışılan tüm Türkiye kahverengi alabalık toplumlarında sabit frekans göstermiştir. ND-5/6 geni 8 restriksiyon enzimi ile kesildi. Bu enzimlerin altısı ile gruplararası varyasyon bulundu. Üç populasyonda iki haplotip gözlendi. Bu haplotiplerden birincisi güney-batı Anadolu; Alakır populasyonunda, ikincisi ise orta-kuzey Anadolu; Abant populasyonunda ve doğu Karadeniz; Sümer populasyonunda sabit frekans göstermiştir. Bu çalışmanın sonuçlan, DNA standartlarından elde edilen sonuçlarla karşılaştırıldığında günet-batı Anadolu populasyonunun Akdeniz filogenetik grubuna ait olduğu bulundu. Aynı karşılaştırma orta-kuzey Anadolu ve Doğu Karadeniz toplumlarının Tuna grubuna ait olabileceğini göstermiştir. Anahtar kelimeler: Kahverengi alabalık toplumları, polimeraz zincir reaksiyonu, Kesim parçacıkları uzunluk polimorfizmi (RFLP), haplotip, ND-1 geni, ND-5/6 geni, mitokondriyal DNA varyasyonu, filogenetik grup.