Ögrenim Bilgisi


Doktora
2002 - 2008
George Mason University, Bilgisayar Bilimi (Computer Science), Amerika Birleşik Devletleri

Yüksek Lisans
1999 - 2001
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği (Yl) (Tezli), Türkiye

Lisans
1995 - 1999
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü, Türkiye

Yaptığı Tezler

Doktora, Query consolidation: Interpreting queries sent to independent heterogenous databases, George Mason University, Bilgisayar Bilimi (Computer Science), 2008
Yüksek Lisans, Synthesis, modification and characterization of sodalites, Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kimya Mühendisliği (Yl) (Tezli), 2001

Akademik Unvanlar / Görevler


Dr.Öğr.Üyesi
2018 - Devam Ediyor
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı

Yrd.Doç.Dr.
2012 - 2018
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı

Öğretim Görevlisi
2009 - 2012
İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

Araştırma Görevlisi
2002 - 2008
George Mason University

Araştırma Görevlisi
2001 - 2002
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Bilgisayar Mühendisliği Bölümü

Araştırma Görevlisi
1999 - 2001
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü

SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler

  1. Defining a master curve of abdominal aortic aneurysm growth and its potential utility of clinical management
    Akkoyun E., Gharahi H., Kwon S. T. , Zambrano B. A. , Rao A., ACAR A. C. , Lee W., Baek S.
    Computer Methods and Programs in Biomedicine, cilt.208, 2021 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
  2. Projecting the course of COVID-19 in Turkey: A probabilistic modeling approach
    Acar A. C. , Er A. G. , Burduroğlu H. C. , Sülkü S. N. , Aydin Son Y., Akin L., Ünal S.
    TURKISH JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES, cilt.51, sa.1, ss.16-27, 2021 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
  3. The Use of Informed Priors in Biclustering of Gene Expression with the Hierarchical Dirichlet Process
    Tercan B., Acar A. C.
    IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, cilt.17, sa.5, ss.1810-1821, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
  4. iBioProVis: interactive visualization and analysis of compound bioactivity space
    Dönmez A., Rifaioğlu A. S. , Acar A. C. , Doğan T., Cetin-Atalay R., Atalay V.
    BIOINFORMATICS, cilt.36, sa.14, ss.4227-4230, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
  5. Real-time Malaria Parasite Screening in Thick Blood Smears for Low-Resource Setting
    Chibuta S., Acar A. C.
    JOURNAL OF DIGITAL IMAGING, cilt.33, sa.3, ss.763-775, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
  6. Predicting abdominal aortic aneurysm growth using patient-oriented growth models with two-step Bayesian inference
    Akkoyun E., Kwon S. T. , Acar A. C. , Lee W., Baek S.
    COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, cilt.117, 2020 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
  7. mESAdb: microRNA Expression and Sequence Analysis Database
    Kaya K., Karakülah G., Yakicier C., Acar A. C. , Konu O.
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH, cilt.39, 2011 (SCI İndekslerine Giren Dergi)
  8. The synthesis and sodium-silver ion exchange of sodalites
    Acar A. C. , Yucel H., Culfaz A.
    CHEMICAL ENGINEERING COMMUNICATIONS, cilt.190, ss.861-882, 2003 (SCI İndekslerine Giren Dergi)

Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler

  1. Personalized Tumor Growth Prediction Using Multiscale Modeling
    ÜNSAL S., Acar A. C. , Itik M., KABATAŞ A., GEDİKLİ Ö., ÖZDEMİR F., TURHAN K.
    JOURNAL OF BASIC AND CLINICAL HEALTH SCIENCES, cilt.4, sa.3, ss.347-363, 2020 (ESCI İndekslerine Giren Dergi)

Kitap & Kitap Bölümleri

  1. Inferring User Goals from Sets of Independent Queries in a Multidatabase Environment
    ACAR A. C. , MOTRO A.
    Advances in Intelligent Information Systems, Zbigniew W Ras, Li-Shiang Tsay, Editör, Springer, Berlin, ss.225-243, 2010

Hakemli Kongre / Sempozyum Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar

  1. iBioProVis: Interactive Visualization and Analysis of Compound Bioactivity Space
    Dönmez A., RİFAİOĞLU A. S. , ACAR A. C. , DOĞAN T., Martin M. J. , ATALAY R., ATALAY M. V.
    27th Conference on Intellient Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology, Basel, İsviçre, 21 - 25 Temmuz 2019
  2. COMBINATION THERAPY FOR HEPATOCELLULAR CARCINOMA: A SYSTEMS BIOLOGY PERSPECTIVE ON THE SYNERGISTIC ANTITUMOR ACTIVITY OF SORAFENIB WITH PI3K/AKT PATHWAY INHIBITORS
    Erşahin T., Tunçbağ N., Acar A. C. , Atalay R.
    50th International Liver Congress of the European-Association-for-the-Study-of-the-Liver, Vienna, Avusturya, 22 - 26 Nisan 2015, cilt.62, ss.464
  3. Cross-Cultural Audiences and Their Perceptions of Music in a Biological Context: Transforming “Music Within” Art Installation into a Cross-Cultural Interface
    Bozlak E., ACAR A. C. , SÜRER E.
    International “Music and Sciences” Symposium, İstanbul, Türkiye, 17 - 19 Nisan 2019, ss.57
  4. Design and Evaluation of an Interactive Art Installation to Introduce 'de novo' Mutations to Different Audiences: "Music Within" Project
    Bozlak E., ACAR A. C. , SÜRER E.
    4th EAI International Conference on Smart Objects and Technologies for Social Good, Bologna, İtalya, 28 - 30 Kasım 2018, ss.82-87
  5. Gene mutations involved in drug resistance in liver cancer cells using a new rna-seq data analysis workflow
    Guzelcan E. A. , Shojaei M., ACAR A. F. , ATALAY R.
    42nd European-Society-for-Medical-Oncology Congress (ESMO), Madrid, İspanya, 8 - 12 Eylül 2017, cilt.28
  6. A framework for applying bioinformatics analysis of drug resistance to mathematical tumor models
    ÜNSAL S., ACAR A. C. , İTİK M., KURT B., ÜNSAL Ü., TURHAN K.
    NGS Tech Applications Congress: USA, Amerika Birleşik Devletleri, 25 - 26 Temmuz 2017
  7. A Method Proposal for Revealing Epigenetic Immune-Escape Mechanisms Using 450k Methylation Array Data
    KASAP B., ÜNSAL S., AYDIN KASAP Z., ACAR A. C. , TURHAN K.
    10. International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT), 28 - 30 Haziran 2017
  8. Identification of Gene Mutations Involved in Drug Resistance in Liver Cancer Using Rna-Seq Data Analysis
    Shojeai M., Akhan E., ACAR A. C. , ATALAY R.
    The International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics, (HIBIT), 28 - 30 Haziran 2017
  9. Kişiselleştirilmiş Tıp Uygulamaları ve Bir Örnek
    ÜNSAL S., ACAR A. C. , İTİK M., KABATAŞ A., GEDİKLİ Ö., TURHAN K.
    Tıp Bilişiminde Yenilikler Sempozyumu, Türkiye, 25 Mart 2017
  10. Segmenting and Labeling Query Sequences in a Multidatabase Environment
    Acar A. C. , Motro A.
    Confederated International Workshops and Posters: EI2N plus NSF ICE, ICSP plus INBAST, ISDE, ORM, OTMA, SWWS plus MONET plus SeDeS, and VADER, Hersonissos, Yunanistan, 17 - 21 Ekim 2011, cilt.7044, ss.367-368
  11. Efficient discovery of join plans in schemaless data
    ACAR A. C. , Motro A.
    Proceedings of the 2009 International Database Engineering Applications Symposium on - IDEAS ’xx09, Cetraro - Calabria, Italy, 16 - 18 Eylül 2009
  12. Query Consolidation: Interpreting a Set of Independent Queries Using a Multidatabase Architecture in the Reverse Direction
    ACAR A. C. , Motro A.
    14th International Workshop on New Trends in Information Integration, VLDB-NTII 2008, 24 - 30 Ağustos 2008
  13. Why is this User Asking so Many Questions Explaining Sequences of Queries
    ACAR A. C. , AMIHAI M.
    18th Annual IFIP TC11/WG 11.3 Conference on Data and Applications Security, Sitges, İspanya, 25 - 28 Temmuz 2004
  14. Utility Based Resolution of Data Inconsistencies
    MOTRO A., ANOKHIN P., ACAR A. C.
    Proceedings of the International Workshop on Information Quality in Information Systems, 23th ACM SIGMOD International Conference on Management of Data, 13 - 18 Temmuz 2004

Akademik İdari Deneyim

2016 - 2018 Anabilim/Bilim Dalı Başkanı Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Siber Güvenlik Anabilim Dalı
2012 - 2016 Program Koordinatörü Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Enformatik Enstitüsü, Sağlık Bilişimi Anabilim Dalı

Araştırma Alanları

Biyoenformatik, Veritabanı Sistemleri , Yapay Zeka, Bilgisayarda Öğrenme ve Örüntü Tanıma, Belirsizlik Yönetimi , Bilgisayar Öğrenimi, Biyoinformatik, Biyolojik Modelleme, Biyolojik Veritabanları